More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01270 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
340 aa  685    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.59 
 
 
340 aa  603  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.82 
 
 
355 aa  594  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.12 
 
 
340 aa  511  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.9 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.39 
 
 
342 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.73 
 
 
342 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.54 
 
 
342 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.59 
 
 
355 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.07 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 
340 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.26 
 
 
353 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.32 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.42 
 
 
337 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.43 
 
 
337 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
351 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.06 
 
 
353 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 
356 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 
358 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
351 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
358 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
354 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 
338 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
334 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
351 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.66 
 
 
351 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.46 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
334 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.81 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.05 
 
 
541 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.25 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.66 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.06 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 
334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
333 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.49 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
345 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
333 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
333 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
336 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 
336 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 
341 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
348 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
333 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 
344 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
352 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 
356 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
333 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
354 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 
352 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
334 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.08 
 
 
345 aa  394  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 
343 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
333 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
346 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
348 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 
336 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.88 
 
 
334 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.46 
 
 
334 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
352 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 
334 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.05 
 
 
333 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 
355 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 
343 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 
342 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
357 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 
354 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
355 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 
357 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
363 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 
346 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.62 
 
 
334 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
339 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>