More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1767 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 352 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  89.6 
 
 		 344 aa  591  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.3 
 
 		 348 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  81.87 
 
 		 344 aa  564  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.06 
 
 		 346 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.46 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.15 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.53 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.66 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.14 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 		 342 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.14 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.26 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.42 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.68 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.33 
 
 		 339 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.11 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.03 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.71 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.56 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.15 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.52 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3493  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.91 
 
 		 324 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.1 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0997  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.04 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.73 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.91 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.86 
 
 		 337 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>