More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0587 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 338 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  84.23 
 
 		 343 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.02 
 
 		 348 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.24 
 
 		 346 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 		 352 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.6 
 
 		 344 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.82 
 
 		 344 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.94 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.91 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.52 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.73 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.16 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.18 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 342 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.82 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.4 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 357 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 348 aa  381  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.74 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.62 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.48 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.7 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.37 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.66 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.64 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.66 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.02 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.52 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0989  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.52 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.137899 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 355 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>