More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1251 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 355 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.95 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.07 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.59 
 
 		 340 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.58 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.09 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.79 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.69 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.69 
 
 		 342 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.62 
 
 		 342 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.35 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 		 348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.7 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.14 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.2 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.89 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.73 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.62 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 337 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.87 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 348 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.11 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.15 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.02 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.7 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0278  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.043434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.89 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.77 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  60.38 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.18 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.18 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.02 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>