More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0278 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0278  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
345 aa  696    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.043434  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.65 
 
 
339 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.99 
 
 
342 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 
340 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 
342 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 
355 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 
340 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 
340 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
355 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.93 
 
 
340 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 
348 aa  371  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
358 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 
336 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
343 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.69 
 
 
334 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 
343 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 
348 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.06 
 
 
338 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 
351 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.95 
 
 
344 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
337 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 
341 aa  364  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
344 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
352 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 
338 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
337 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
336 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 
351 aa  361  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.39 
 
 
338 aa  361  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 
345 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.37 
 
 
337 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.14 
 
 
334 aa  360  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 
335 aa  360  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.17 
 
 
346 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 
338 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
336 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  53.31 
 
 
349 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.8 
 
 
338 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 
356 aa  359  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 
336 aa  359  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 
345 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 
354 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.03 
 
 
337 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 
355 aa  359  4e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.85 
 
 
346 aa  359  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.11 
 
 
358 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
334 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.09 
 
 
335 aa  358  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
334 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.77 
 
 
353 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
334 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.16 
 
 
337 aa  358  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
346 aa  358  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
334 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 
351 aa  357  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.73 
 
 
349 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.11 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.98 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.7 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.92 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 
343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.91 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.43 
 
 
343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 
357 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 
334 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.97 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 
357 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.84 
 
 
344 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.87 
 
 
336 aa  355  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 
343 aa  355  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.45 
 
 
337 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.91 
 
 
334 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
334 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.85 
 
 
338 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.32 
 
 
354 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
334 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 
357 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.13 
 
 
353 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.56 
 
 
334 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.42 
 
 
349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.75 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.61 
 
 
355 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 
334 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.81 
 
 
330 aa  351  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
342 aa  351  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 
354 aa  351  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.39 
 
 
356 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 
356 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>