More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0488 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 343 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.48 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  74.05 
 
 		 340 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.47 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.33 
 
 		 341 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.93 
 
 		 342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.69 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.07 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.54 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.48 
 
 		 342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.3 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 		 344 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.74 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.26 
 
 		 337 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.9 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.59 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.66 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.61 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.43 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.42 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.61 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.13 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.58 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.49 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.26 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.13 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.63 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.15 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.42 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 338 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.04 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.86 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.83 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.64 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.55 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>