More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1642 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 340 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  85.59 
 
 		 340 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  83.24 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.18 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.86 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.3 
 
 		 341 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.95 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.48 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.09 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.12 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.77 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.5 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.28 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.87 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.16 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.31 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.57 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1619  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.15 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.933878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.46 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.29 
 
 		 353 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  58.51 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.18 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.41 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.36 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.49 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.78 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.44 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.87 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.74 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.09 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.13 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.68 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.31 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.27 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>