More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0373 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 342 aa  688    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.06 
 
 		 341 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.32 
 
 		 342 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.71 
 
 		 342 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.3 
 
 		 340 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.81 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.73 
 
 		 340 aa  495  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.95 
 
 		 340 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.07 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.93 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.64 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  64 
 
 		 354 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.11 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.61 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.39 
 
 		 355 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.46 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.38 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.66 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.26 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0569  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.56 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.64 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0616  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.75 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.02 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.75 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 352 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.95 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.33 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.94 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.97 
 
 		 541 aa  394  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 		 334 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.25 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0587  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.8 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.69 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.68 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.51 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.27 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.24 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.9 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.06 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.1 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0278  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.043434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.13 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.12 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.5 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.94 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 337 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.44 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.13 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.7 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>