More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0997 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0997  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
342 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1014  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.3 
 
 
342 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1011  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.3 
 
 
342 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0953  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.01 
 
 
342 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.44 
 
 
338 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 
338 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.91 
 
 
341 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 
352 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.55 
 
 
338 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 
337 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.74 
 
 
337 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.74 
 
 
342 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
355 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 
358 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0505  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 
340 aa  375  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0426795  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.57 
 
 
336 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.72 
 
 
344 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.5 
 
 
354 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
342 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
345 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
357 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
334 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
357 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
345 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 
357 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 
336 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 
336 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.07 
 
 
348 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 
355 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 
355 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 
353 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 
330 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 
345 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 
336 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3908  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 
376 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.36 
 
 
356 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 
340 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 
363 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 
341 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.89 
 
 
356 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.87 
 
 
352 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 
347 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 
350 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.25 
 
 
336 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.27 
 
 
344 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 
355 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 
342 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.27 
 
 
346 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 
346 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
343 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.85 
 
 
354 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
336 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.9 
 
 
343 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.02 
 
 
350 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 
354 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 
336 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.12 
 
 
354 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
343 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.84 
 
 
334 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 
340 aa  364  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 
356 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
356 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 
356 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 
357 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
334 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 
356 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 
358 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.55 
 
 
342 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 
352 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 
363 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.32 
 
 
338 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 
361 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 
341 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.73 
 
 
335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.81 
 
 
356 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.74 
 
 
336 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 
339 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.5 
 
 
334 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.41 
 
 
336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>