More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0953 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1014  Holliday junction DNA helicase RuvB  99.71 
 
 		 342 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0953  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 342 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1011  Holliday junction DNA helicase RuvB  99.71 
 
 		 342 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0997  Holliday junction DNA helicase RuvB  88.01 
 
 		 342 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.1 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.61 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.55 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 337 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 		 340 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.35 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.8 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.76 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.67 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.02 
 
 		 339 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.6 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.51 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 345 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.32 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.21 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.09 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.09 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.51 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.92 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  53.43 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.6 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3493  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.42 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.19 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.89 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0522  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.42 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.74 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.9 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.47 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.52 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3908  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 363 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0473  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0886015  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.21 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  55.21 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.04 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.4 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0488  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.29 
 
 		 343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.01 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.05 
 
 		 344 aa  361  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 		 352 aa  361  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.83 
 
 		 337 aa  360  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.87 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>