More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0596 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  100 
 
 		 452 aa  904    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  68.81 
 
 		 452 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  56.31 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  53.66 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  52.38 
 
 		 450 aa  471  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  52.99 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  53.06 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  56.26 
 
 		 441 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  50.22 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.07 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  42.95 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  42.11 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.79 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  42.45 
 
 		 459 aa  349  6e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  42.05 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  39.95 
 
 		 455 aa  338  8e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  41.52 
 
 		 451 aa  336  5e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  39.38 
 
 		 484 aa  332  6e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  43.59 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.87 
 
 		 631 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  44.87 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  45.95 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.59 
 
 		 640 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  44.59 
 
 		 640 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  41.86 
 
 		 630 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2639  vesicle-fusing ATPase  33 
 
 		 584 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.774976  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  44.44 
 
 		 639 aa  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.78 
 
 		 584 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.69 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  42.17 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  41.89 
 
 		 584 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  42.17 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  42.31 
 
 		 641 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  43.59 
 
 		 633 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.69 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  38.81 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.83 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.51 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  43.24 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  41.89 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 		 697 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  47.14 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.44 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  41.89 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  44.44 
 
 		 628 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.12 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.14 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  44.44 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  44.44 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.44 
 
 		 632 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.44 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  63.16 
 
 		 630 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  42.35 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 608 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1848  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 		 660 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.462699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  33.01 
 
 		 691 aa  48.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 		 781 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 		 781 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.91 
 
 		 723 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3280  ATPase central domain-containing protein  42.86 
 
 		 660 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.940995  normal  0.620187 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  36.84 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  39.53 
 
 		 667 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 		 784 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  42.86 
 
 		 673 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  40.96 
 
 		 694 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  44.62 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  46.15 
 
 		 599 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 644 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 697 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 604 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  45.83 
 
 		 646 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  41.46 
 
 		 699 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  39.53 
 
 		 632 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  39.76 
 
 		 692 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  38.55 
 
 		 615 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.86 
 
 		 620 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 676 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  40.54 
 
 		 584 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 616 aa  47  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 621 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.67 
 
 		 621 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 		 685 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 631 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 655 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  41.89 
 
 		 577 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.19 
 
 		 598 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.77 
 
 		 800 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.14 
 
 		 662 aa  47  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 621 aa  47  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  37.11 
 
 		 663 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.62 
 
 		 618 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.81 
 
 		 633 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.76 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  37.8 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  37.8 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.57 
 
 		 697 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  39.02 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>