More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3280 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3280  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 660 aa  1354    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.940995  normal  0.620187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1848  ATPase central domain-containing protein  95.15 
 
 		 660 aa  1251    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.462699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  72.52 
 
 		 657 aa  932    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1135  AAA ATPase central domain protein  35.19 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.394156  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0444  AAA ATPase central domain protein  35.05 
 
 		 616 aa  273  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1869  ATPase central domain-containing protein  34.05 
 
 		 691 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.6 
 
 		 649 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  32.24 
 
 		 627 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  31.02 
 
 		 629 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.43 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.02 
 
 		 629 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.93 
 
 		 631 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.93 
 
 		 631 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.93 
 
 		 627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  30.76 
 
 		 632 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  32.3 
 
 		 628 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  30.73 
 
 		 628 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.76 
 
 		 628 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.46 
 
 		 631 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.57 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  31.37 
 
 		 637 aa  251  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.13 
 
 		 621 aa  250  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 628 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.76 
 
 		 631 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.76 
 
 		 631 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.06 
 
 		 628 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.64 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.57 
 
 		 621 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.82 
 
 		 627 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.15 
 
 		 635 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 673 aa  243  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.58 
 
 		 635 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.03 
 
 		 639 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  30.63 
 
 		 608 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 		 621 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.98 
 
 		 652 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.86 
 
 		 652 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.59 
 
 		 630 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  34.26 
 
 		 625 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.9 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.68 
 
 		 634 aa  241  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.12 
 
 		 696 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.37 
 
 		 640 aa  241  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  33.47 
 
 		 635 aa  241  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.01 
 
 		 599 aa  240  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.5 
 
 		 640 aa  240  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.93 
 
 		 685 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.76 
 
 		 697 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.09 
 
 		 631 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  31.28 
 
 		 641 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 		 612 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  35.13 
 
 		 624 aa  240  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.77 
 
 		 653 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 		 639 aa  239  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.3 
 
 		 614 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  31.52 
 
 		 639 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.97 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  32.43 
 
 		 673 aa  239  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1844  AAA ATPase central domain protein  31.59 
 
 		 800 aa  238  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.27 
 
 		 717 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.58 
 
 		 655 aa  239  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  31.27 
 
 		 614 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  31.43 
 
 		 646 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 612 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  34.7 
 
 		 620 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.07 
 
 		 671 aa  238  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.28 
 
 		 628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.66 
 
 		 681 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 628 aa  237  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  35.21 
 
 		 629 aa  236  8e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.68 
 
 		 642 aa  236  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.35 
 
 		 676 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.52 
 
 		 697 aa  236  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.52 
 
 		 697 aa  236  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  34.7 
 
 		 619 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3487  AAA ATPase, central region  30.43 
 
 		 827 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 		 662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  33.27 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.02 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.07 
 
 		 713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.02 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  31.51 
 
 		 658 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0819  cell division protein FtsH  32.03 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 666 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.15 
 
 		 714 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 666 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  35.34 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.83 
 
 		 646 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.53 
 
 		 647 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 852 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  31.65 
 
 		 692 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>