More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0128 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
614 aa  1235    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.06 
 
 
671 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  48.59 
 
 
612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  43.49 
 
 
639 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  50.31 
 
 
628 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.03 
 
 
616 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.4 
 
 
651 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.46 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  46.9 
 
 
644 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  49.46 
 
 
641 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.94 
 
 
641 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.79 
 
 
651 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  47.09 
 
 
649 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.76 
 
 
638 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.12 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  43.69 
 
 
644 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.69 
 
 
647 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 
630 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.56 
 
 
637 aa  438  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.08 
 
 
628 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  51.55 
 
 
639 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  51.55 
 
 
639 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.61 
 
 
638 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  46.17 
 
 
640 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43 
 
 
634 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  43.69 
 
 
647 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  43.69 
 
 
647 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  43.69 
 
 
647 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.58 
 
 
612 aa  439  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  42.11 
 
 
641 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.27 
 
 
638 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.39 
 
 
655 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.39 
 
 
638 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  46.92 
 
 
629 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.39 
 
 
638 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
655 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.58 
 
 
612 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 
602 aa  438  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  43.69 
 
 
644 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.55 
 
 
656 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  43.69 
 
 
644 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  42.9 
 
 
644 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.03 
 
 
650 aa  435  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  40.84 
 
 
614 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.69 
 
 
654 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  42.74 
 
 
644 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.21 
 
 
598 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  47.22 
 
 
633 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.77 
 
 
635 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  43.52 
 
 
647 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.64 
 
 
608 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
634 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.78 
 
 
621 aa  435  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2307  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
599 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0665193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  41.57 
 
 
635 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.89 
 
 
656 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.57 
 
 
635 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.59 
 
 
621 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
651 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  48.84 
 
 
627 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
631 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  42.24 
 
 
628 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.76 
 
 
642 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.56 
 
 
640 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.88 
 
 
640 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.57 
 
 
635 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.62 
 
 
652 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 
628 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.22 
 
 
637 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.99 
 
 
640 aa  432  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 
640 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
660 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  43.34 
 
 
647 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  50.55 
 
 
634 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  43.34 
 
 
647 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
629 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.91 
 
 
626 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  45.86 
 
 
627 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.12 
 
 
630 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  43.34 
 
 
647 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  49.48 
 
 
644 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  46.85 
 
 
632 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49.27 
 
 
647 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
647 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  46.73 
 
 
628 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  49.27 
 
 
643 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  43.34 
 
 
647 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  46.73 
 
 
628 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.29 
 
 
640 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.77 
 
 
639 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 
628 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.18 
 
 
639 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 
645 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.89 
 
 
812 aa  430  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.86 
 
 
645 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  46.73 
 
 
628 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.87 
 
 
657 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.07 
 
 
628 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.73 
 
 
631 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  51.11 
 
 
639 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>