55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43499 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  100 
 
 
462 aa  937    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  65.49 
 
 
463 aa  628  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  63.36 
 
 
468 aa  604  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  62.83 
 
 
484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  59.73 
 
 
451 aa  567  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  42.7 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  39.78 
 
 
484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  41.67 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  41.56 
 
 
456 aa  352  8e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  41.57 
 
 
450 aa  350  3e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.83 
 
 
485 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  41.57 
 
 
450 aa  348  1e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  42.5 
 
 
441 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  42.4 
 
 
451 aa  347  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  39.96 
 
 
455 aa  347  3e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  40.55 
 
 
459 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  39.91 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  42.95 
 
 
452 aa  335  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  43.61 
 
 
452 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  45.16 
 
 
775 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  50 
 
 
619 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  26.03 
 
 
538 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  36.08 
 
 
1284 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  52 
 
 
599 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 
711 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.03 
 
 
664 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.19 
 
 
781 aa  45.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.03 
 
 
685 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.9 
 
 
642 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  45.28 
 
 
691 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  48.84 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.19 
 
 
784 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.19 
 
 
800 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.48 
 
 
643 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.19 
 
 
781 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.97 
 
 
667 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.03 
 
 
690 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  45.61 
 
 
729 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.98 
 
 
633 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.17 
 
 
678 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  47.06 
 
 
646 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48 
 
 
598 aa  43.1  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>