More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0253 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  100 
 
 		 452 aa  896    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  68.81 
 
 		 452 aa  631  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  58.69 
 
 		 456 aa  511  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  55.6 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  54.51 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  58.18 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  54.52 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  53.85 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  49.78 
 
 		 448 aa  428  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  44.22 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  45.41 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  43.61 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  43.02 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  43.79 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  44.71 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  42.24 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.42 
 
 		 485 aa  345  7e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  41.69 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  40.09 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.09 
 
 		 731 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 584 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  40.3 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 608 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  38.95 
 
 		 584 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 577 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  38.95 
 
 		 584 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.87 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  45.71 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 		 604 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.87 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  60 
 
 		 1301 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  35.85 
 
 		 584 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.5 
 
 		 348 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2733  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 		 671 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.622725  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.22 
 
 		 631 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.16 
 
 		 759 aa  50.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  47.22 
 
 		 628 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.59 
 
 		 628 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  38.81 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.02 
 
 		 697 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  39.13 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 		 640 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  43.59 
 
 		 628 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.14 
 
 		 640 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  45.71 
 
 		 630 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  41.38 
 
 		 657 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 731 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  44.44 
 
 		 637 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  58.14 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  58.14 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  45.83 
 
 		 633 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  41.86 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  41.98 
 
 		 665 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  43.59 
 
 		 648 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  42.5 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 731 aa  49.3  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.75 
 
 		 731 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  36.9 
 
 		 691 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 686 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.59 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.28 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.27 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  44.44 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.29 
 
 		 616 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  40 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03320  AAA+ family ATPase  38.75 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.12 
 
 		 701 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.57 
 
 		 662 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.18 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.07 
 
 		 718 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  39.02 
 
 		 614 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  43.06 
 
 		 640 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  43.06 
 
 		 640 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  44.44 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.19 
 
 		 781 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.19 
 
 		 723 aa  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.43 
 
 		 644 aa  48.5  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0392  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.29 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297627 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.19 
 
 		 784 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  33.72 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  53.06 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  42.31 
 
 		 667 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  43.86 
 
 		 930 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  53.19 
 
 		 781 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1848  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 660 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.462699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.14 
 
 		 676 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  38.46 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  39.53 
 
 		 639 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 608 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 		 685 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3521  Holliday junction DNA helicase RuvB  48 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  53.19 
 
 		 513 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  45.71 
 
 		 612 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 		 607 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  38.55 
 
 		 615 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.64 
 
 		 348 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3280  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 660 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.940995  normal  0.620187 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  41.89 
 
 		 637 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>