More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03320  AAA+ family ATPase  100 
 
 
394 aa  791    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02590  AAA+ family ATPase  37.16 
 
 
388 aa  206  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.425003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  31.56 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 
321 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  36.71 
 
 
1930 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 
664 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  32.64 
 
 
310 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  36.86 
 
 
541 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  37.23 
 
 
678 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  38.14 
 
 
1110 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  37.5 
 
 
298 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  35.04 
 
 
617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  34.38 
 
 
301 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  32.5 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  31.38 
 
 
310 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  32.56 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  31.49 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  31.49 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 
322 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  32.4 
 
 
505 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  32.64 
 
 
466 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  31.37 
 
 
839 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  38.28 
 
 
390 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  33.21 
 
 
308 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 
855 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  32.77 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  33.19 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  31.36 
 
 
653 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  31.39 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.19 
 
 
312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  35.34 
 
 
596 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1657  CbbX protein  36.33 
 
 
323 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  35 
 
 
318 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  33.62 
 
 
466 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  32.77 
 
 
318 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  36.63 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  32.73 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  31.91 
 
 
329 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 
341 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 
341 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  32.35 
 
 
318 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  30.62 
 
 
304 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  31.62 
 
 
1105 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  33.08 
 
 
311 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  33.88 
 
 
312 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  32.63 
 
 
780 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  34.5 
 
 
318 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 
348 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  34.85 
 
 
310 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  30.85 
 
 
341 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  34.58 
 
 
301 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  32.2 
 
 
310 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  31.51 
 
 
334 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  32.5 
 
 
320 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  34 
 
 
1133 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  29.79 
 
 
298 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  30.51 
 
 
309 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  35.38 
 
 
802 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  31.62 
 
 
306 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  30.5 
 
 
304 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  30.5 
 
 
304 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  30.54 
 
 
318 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 
344 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  36.95 
 
 
681 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  29.78 
 
 
819 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  32.3 
 
 
305 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  35.05 
 
 
823 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  31.62 
 
 
320 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  29.25 
 
 
309 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  32.05 
 
 
564 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  33.5 
 
 
344 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  38.61 
 
 
487 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  29.34 
 
 
550 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  31.36 
 
 
779 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  33.51 
 
 
317 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  29.74 
 
 
366 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  30.33 
 
 
306 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  33.51 
 
 
469 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  31.82 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  31.82 
 
 
306 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  31.82 
 
 
307 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  31 
 
 
308 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  36.68 
 
 
558 aa  97.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 
2310 aa  96.3  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  30.74 
 
 
349 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  31.03 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  28.41 
 
 
846 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  36.46 
 
 
615 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  35.45 
 
 
591 aa  93.6  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  36.46 
 
 
616 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  35.42 
 
 
631 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 
573 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 
573 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 
594 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>