More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  100 
 
 
466 aa  961    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  43.39 
 
 
617 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  49.26 
 
 
466 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  47.45 
 
 
365 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  52.03 
 
 
344 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  47.21 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  47.53 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  47.53 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  51.66 
 
 
344 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  49.82 
 
 
469 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  46.28 
 
 
541 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  47.25 
 
 
329 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  47.1 
 
 
839 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  44.6 
 
 
331 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  45.09 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  45.05 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  47.74 
 
 
298 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  46.39 
 
 
321 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  45.82 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  47.12 
 
 
1110 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  44.32 
 
 
310 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  44.74 
 
 
322 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  45.36 
 
 
1930 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  39.67 
 
 
1105 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  45.09 
 
 
309 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  47.57 
 
 
664 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  43.75 
 
 
320 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  51.81 
 
 
379 aa  229  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  51.81 
 
 
341 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  55.67 
 
 
390 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  51.81 
 
 
341 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  46.15 
 
 
299 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  40.98 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  47.15 
 
 
366 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  49.4 
 
 
855 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  44.36 
 
 
308 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  45.12 
 
 
321 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  44.74 
 
 
306 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  45.15 
 
 
310 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 
309 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  45 
 
 
311 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  44.36 
 
 
304 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  44.36 
 
 
304 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
653 aa  223  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  42.7 
 
 
318 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  45.42 
 
 
678 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  46.41 
 
 
317 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  43.61 
 
 
310 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  44.15 
 
 
298 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  42.65 
 
 
318 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  45.45 
 
 
307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  43.61 
 
 
306 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  42.2 
 
 
307 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  47.95 
 
 
354 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  44.36 
 
 
308 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  44.15 
 
 
334 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  45.12 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  44.62 
 
 
304 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  44.86 
 
 
846 aa  214  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  45.78 
 
 
564 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  42.28 
 
 
318 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  44.11 
 
 
301 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  42.63 
 
 
349 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  44.77 
 
 
823 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  42.65 
 
 
301 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  42.23 
 
 
329 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.8 
 
 
312 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  38.73 
 
 
487 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  43.46 
 
 
550 aa  203  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
819 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1657  CbbX protein  45.99 
 
 
323 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  43.43 
 
 
779 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  42.65 
 
 
780 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  43.8 
 
 
681 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  43.61 
 
 
305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  41.05 
 
 
312 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  45.71 
 
 
631 aa  193  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  41.94 
 
 
596 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  43.26 
 
 
802 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  42.4 
 
 
505 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  45.16 
 
 
594 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  45.16 
 
 
594 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  40.75 
 
 
594 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  46.05 
 
 
616 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  43.93 
 
 
593 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  40 
 
 
1133 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  39.86 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  43.81 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  45.89 
 
 
573 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  45.89 
 
 
573 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>