More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0029 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  100 
 
 		 469 aa  967    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  53.99 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  53.99 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  47.67 
 
 		 617 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  52.31 
 
 		 541 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  51.54 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  46.59 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  49.22 
 
 		 839 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  45.36 
 
 		 855 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  47.12 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  47.15 
 
 		 678 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  46.31 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  49.26 
 
 		 344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  45.79 
 
 		 1105 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  45.33 
 
 		 329 aa  232  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  47.97 
 
 		 341 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  47.97 
 
 		 341 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  48.52 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  41.41 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  46.42 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  48.76 
 
 		 664 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  50.2 
 
 		 1110 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  46.62 
 
 		 1930 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  42.54 
 
 		 487 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  41.11 
 
 		 348 aa  222  9e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  45.21 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  41.06 
 
 		 321 aa  220  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  44.65 
 
 		 846 aa  219  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  48.85 
 
 		 354 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  42.32 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  42.86 
 
 		 310 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  43.91 
 
 		 780 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  47.69 
 
 		 681 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  44.84 
 
 		 564 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  45.09 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  45.08 
 
 		 653 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  38.66 
 
 		 318 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  42.59 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.26 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  42.57 
 
 		 318 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  42.57 
 
 		 318 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  40.07 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  40.45 
 
 		 318 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  42.57 
 
 		 318 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  40.45 
 
 		 318 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  40.45 
 
 		 318 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  40.45 
 
 		 318 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  42.57 
 
 		 318 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  42.57 
 
 		 318 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  46.44 
 
 		 802 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  44.57 
 
 		 823 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  47.03 
 
 		 819 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  45.21 
 
 		 779 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  42.56 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  44.86 
 
 		 596 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  40.82 
 
 		 318 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  40.89 
 
 		 322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  39.8 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  40.07 
 
 		 320 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  37.75 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  44.27 
 
 		 558 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  39.6 
 
 		 308 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  40.22 
 
 		 307 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  40.58 
 
 		 616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  40.29 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  39.38 
 
 		 304 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  39.38 
 
 		 304 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  41.22 
 
 		 574 aa  183  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  39.86 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  39.93 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  39.71 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  39.93 
 
 		 301 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  38.27 
 
 		 310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  39.1 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  47.12 
 
 		 631 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  38.49 
 
 		 591 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  39.46 
 
 		 329 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  38.49 
 
 		 310 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 573 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  38.16 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  42.53 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  46.04 
 
 		 615 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  38.41 
 
 		 573 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 573 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  38.16 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  38.52 
 
 		 318 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  38.04 
 
 		 298 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  40.22 
 
 		 305 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  40.38 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  46.6 
 
 		 594 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  46.6 
 
 		 594 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  46.6 
 
 		 594 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  37.99 
 
 		 573 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0773  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 		 574 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  37.64 
 
 		 334 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  40.16 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  38.28 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  38.02 
 
 		 1133 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  37.2 
 
 		 307 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  43.69 
 
 		 593 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>