145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3030 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  100 
 
 		 310 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  86.94 
 
 		 298 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  73.96 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  68.56 
 
 		 306 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  68.14 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  68.47 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  68.14 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  68.32 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  66.56 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  70.71 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  66.45 
 
 		 341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  65.85 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  65.85 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  69.04 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  65.55 
 
 		 310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  66.55 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  69.06 
 
 		 320 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  66.12 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  65.55 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  67.47 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  68.23 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  63.14 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  66.06 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08171  RuBisCo-expression protein CbbX  67.51 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  64.58 
 
 		 301 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  65.12 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  62.75 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1657  CbbX protein  67.84 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  67.84 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0636  AAA ATPase central domain-containing protein  58.19 
 
 		 312 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  58.61 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  45.1 
 
 		 318 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  46.21 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  46.09 
 
 		 466 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  45.53 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  43.68 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  45.69 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  42.96 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  44.11 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  45.7 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  45.91 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  41.96 
 
 		 617 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  42.7 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  41.54 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  42.55 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  41.04 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  37.67 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  39.79 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  37.33 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  43.63 
 
 		 678 aa  203  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  42.32 
 
 		 1105 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  43.19 
 
 		 1930 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  44.85 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  45.08 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  43.51 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  43.54 
 
 		 855 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  43.16 
 
 		 664 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  42.81 
 
 		 341 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  41.48 
 
 		 541 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  42.81 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  39.78 
 
 		 653 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  40.73 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.76 
 
 		 839 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 		 780 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  42.19 
 
 		 389 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  42.19 
 
 		 389 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  40.38 
 
 		 846 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  43.75 
 
 		 681 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  40 
 
 		 550 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  38.62 
 
 		 1110 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  41.92 
 
 		 354 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  41.41 
 
 		 596 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  46.01 
 
 		 823 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  41.6 
 
 		 779 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  40.3 
 
 		 564 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  40.74 
 
 		 819 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  38.49 
 
 		 469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  34.82 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  41.77 
 
 		 802 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  39.26 
 
 		 616 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  42.27 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  40.89 
 
 		 558 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  38.1 
 
 		 615 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  35.9 
 
 		 631 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  41.47 
 
 		 574 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  42.42 
 
 		 594 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  42.42 
 
 		 594 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  42.42 
 
 		 594 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  41.01 
 
 		 573 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  40.55 
 
 		 573 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  40.55 
 
 		 573 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  34.56 
 
 		 591 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>