More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1988 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1455  ATPase central domain-containing protein  63.13 
 
 
653 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.183766  hitchhiker  0.0000524636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1988  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
664 aa  1323    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204493  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  56.31 
 
 
855 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  42.76 
 
 
839 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1627  AAA ATPase central domain protein  44.59 
 
 
1110 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.856063  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2403  AAA ATPase central domain-containing protein  43.62 
 
 
779 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7100  ATPase central domain-containing protein  41.7 
 
 
780 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4249  AAA ATPase, central region  41.9 
 
 
846 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  43.22 
 
 
1930 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2144  ATPase  41.78 
 
 
802 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3318  AAA ATPase central domain protein  40.85 
 
 
823 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.488425  normal  0.919341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1454  ATPase central domain-containing protein  68.46 
 
 
366 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000393055 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0170  stage V sporulation protein K  39 
 
 
550 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.129019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1592  AAA ATPase central domain protein  41.39 
 
 
819 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00365213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1517  spoVK domain-containing protein  33.52 
 
 
1133 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.885165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6840  ATPase central domain-containing protein  57.25 
 
 
354 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153796  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4241  AAA ATPase, central region  49.33 
 
 
390 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.434554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4841  ATPase central domain-containing protein  35.7 
 
 
1105 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585558  hitchhiker  0.0091693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1312  AAA ATPase central domain protein  51 
 
 
389 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1283  AAA ATPase central domain protein  51 
 
 
389 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3309  AAA ATPase central domain protein  45.39 
 
 
617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0226  AAA ATPase central domain protein  53.23 
 
 
344 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2862  AAA ATPase central domain protein  51.74 
 
 
379 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1867  ATPase central domain-containing protein  51.76 
 
 
344 aa  238  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0460326  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3526  AAA ATPase central domain protein  48.45 
 
 
341 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1396  AAA ATPase central domain protein  48.45 
 
 
341 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1619  ATPase central domain-containing protein  43.96 
 
 
298 aa  232  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.684878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17420  AAA+ family ATPase  48.28 
 
 
466 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131578  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4389  ATPase central domain-containing protein  40.82 
 
 
466 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0467  ATPase central domain-containing protein  47.81 
 
 
564 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.12935 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0029  AAA+ class-like ATPase  48.84 
 
 
469 aa  228  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.509013  hitchhiker  0.00474583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1118  AAA ATPase  46.35 
 
 
331 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000607625  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2132  AAA ATPase central domain protein  45.28 
 
 
322 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.474775  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3060  AAA ATPase central domain protein  47.06 
 
 
541 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1224  stage V sporulation protein K  46.03 
 
 
310 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11610  AAA ATPase central domain protein  37.79 
 
 
348 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1502  AAA ATPase central domain protein  44.53 
 
 
321 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000852955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2104  stage V sporulation protein K  46.64 
 
 
310 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1880  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
318 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00868854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1566  AAA ATPase central domain protein  46.04 
 
 
329 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2725  AAA ATPase central domain protein  45.97 
 
 
321 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00914326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2067  ATPases of the AAA+ class-like protein  37.85 
 
 
365 aa  206  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0983  hypothetical protein  43.7 
 
 
299 aa  203  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00278176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3584  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 
678 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.883196  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0331  AAA ATPase  40.07 
 
 
320 aa  200  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000626535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3030  CbbX protein  43.44 
 
 
310 aa  200  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00687874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  41.76 
 
 
320 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  48.26 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1496  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0780968  normal  0.0751264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3809  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3737  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3555  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3454  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3467  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3839  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3719  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0200700000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3760  stage V sporulation protein K  41.92 
 
 
318 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3475  sporulation stage V protein K  41.92 
 
 
318 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0352307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2784  AAA type ATPase  41.48 
 
 
298 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  39.79 
 
 
311 aa  197  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2451  CbbX-like protein, putative AAA ATPase  42.45 
 
 
349 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.349953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0673  AAA ATPase, central region  40.08 
 
 
487 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.265099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2387  sporulation stage V protein K  41.92 
 
 
318 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
2310 aa  191  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1197  CbbX protein  39.93 
 
 
307 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  40.08 
 
 
318 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  46.57 
 
 
593 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  43.41 
 
 
301 aa  187  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12600  AAA+ family ATPase  47.49 
 
 
681 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.37602  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0072  ATPase central domain-containing protein  40.07 
 
 
574 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927916  normal  0.0298572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3962  AAA ATPase-like  38.97 
 
 
306 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  41.13 
 
 
309 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  41.13 
 
 
341 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1603  ATPase  40.66 
 
 
301 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1329  AAA ATPase, central region  39.45 
 
 
306 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.272252  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  41.39 
 
 
309 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  40.16 
 
 
334 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1749  CbbX protein  39.61 
 
 
308 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  38.72 
 
 
304 aa  181  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0826  ATPase central domain-containing protein  38.38 
 
 
306 aa  180  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3720  AAA ATPase, central region  40 
 
 
307 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.220422  hitchhiker  0.00179613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  42.11 
 
 
317 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  39.23 
 
 
310 aa  180  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13903  hypothetical protein  41.01 
 
 
573 aa  179  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  41.24 
 
 
591 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1071  ATPase central domain-containing protein  44.49 
 
 
596 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0054  ATPase central domain-containing protein  39.3 
 
 
573 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0220398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  48.72 
 
 
615 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0064  AAA ATPase, central region  39.3 
 
 
573 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0073  ATPase central domain-containing protein  39.3 
 
 
573 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183052  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  48.21 
 
 
594 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42728  predicted protein  36.96 
 
 
505 aa  177  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  46.49 
 
 
631 aa  177  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  39.25 
 
 
304 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  39.25 
 
 
304 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  48.21 
 
 
594 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  48.21 
 
 
594 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  48.21 
 
 
616 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6495  CbbX protein  39.84 
 
 
329 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>