More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0270 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 385 aa  784    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  32.23 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.07 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  30.98 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  29.97 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  31.19 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  29 
 
 		 423 aa  156  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  27.86 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  28.99 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  28.78 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  28.99 
 
 		 484 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  26.21 
 
 		 497 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  29.2 
 
 		 484 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  27.71 
 
 		 514 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  28.8 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  30.55 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  29.32 
 
 		 454 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  29.32 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  29.64 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  27.62 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  26.83 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  28.12 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  27.56 
 
 		 507 aa  135  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  30.6 
 
 		 642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  27.97 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  29.43 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  29.81 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  31.13 
 
 		 764 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  24.78 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  32.27 
 
 		 1092 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  31.71 
 
 		 1001 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.07 
 
 		 892 aa  107  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  28.05 
 
 		 942 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  28.67 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  27.12 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  26.35 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.07 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  33.04 
 
 		 993 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  30.58 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  29.68 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  25.54 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  28.77 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  29.76 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  28.52 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  27.88 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  26.09 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  26.43 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  26.07 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  26.15 
 
 		 1015 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  27.16 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  28.37 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  27.54 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  25.22 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  28.3 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.33 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  27.3 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.83 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  27.03 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  27.03 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  25.32 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  25.5 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  26.64 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  26.46 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  24.44 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  32.04 
 
 		 114 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  27.52 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.19 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  28.36 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  26.32 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  25.87 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  26.85 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  25 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  25.45 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  23.87 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  27.68 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  26.48 
 
 		 289 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.62 
 
 		 520 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  25.32 
 
 		 600 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 587 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  24.89 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  21.33 
 
 		 796 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  24.76 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  26.78 
 
 		 733 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  26.82 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  27.16 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  24.44 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  26.03 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.08 
 
 		 1202 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.76 
 
 		 808 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.52 
 
 		 637 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.57 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.68 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.67 
 
 		 517 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.58 
 
 		 649 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 		 356 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>