More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1751 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  100 
 
 		 451 aa  927    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  56.74 
 
 		 481 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  56.48 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  51.35 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  46.44 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  39.95 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  36.83 
 
 		 497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  41.16 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  39.35 
 
 		 507 aa  293  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  39.72 
 
 		 642 aa  289  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  38.84 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  42.65 
 
 		 500 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  37.23 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  34.29 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  34.37 
 
 		 482 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  33.64 
 
 		 484 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  35.84 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  33.85 
 
 		 492 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  31.47 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  31.88 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  31.83 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.3 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.63 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  27.13 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  29.67 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.32 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  35.38 
 
 		 324 aa  120  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  34.91 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.47 
 
 		 319 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  34.62 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  26.93 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  35.38 
 
 		 325 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.02 
 
 		 329 aa  107  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.3 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  33.96 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  34.13 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  31.98 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  28.21 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  31.86 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  33.02 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.52 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  33.02 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  27.65 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  31.67 
 
 		 327 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  28.98 
 
 		 892 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  30.83 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.65 
 
 		 315 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.09 
 
 		 315 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.09 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  29.2 
 
 		 315 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  29.82 
 
 		 322 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.07 
 
 		 1001 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  27.38 
 
 		 334 aa  94  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  30.14 
 
 		 347 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.49 
 
 		 318 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.65 
 
 		 330 aa  93.2  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.39 
 
 		 326 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31 
 
 		 305 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.71 
 
 		 289 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  30.14 
 
 		 334 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  27.85 
 
 		 1092 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.77 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  27.35 
 
 		 325 aa  89.7  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  29.55 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.48 
 
 		 373 aa  87  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  31.11 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.39 
 
 		 322 aa  86.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.86 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  28.24 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.63 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  29.69 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  27.51 
 
 		 764 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  27.59 
 
 		 942 aa  80.9  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.91 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  28.84 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.65 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  27.36 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  30.28 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.45 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  23.4 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  33.07 
 
 		 940 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.93 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  26.35 
 
 		 1015 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  28.11 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.15 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  25.12 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.5 
 
 		 553 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.02 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.02 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.52 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  25.12 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  22.67 
 
 		 669 aa  63.5  0.000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.6 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  30.61 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  24.64 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.73 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  24.64 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>