More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2049 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  100 
 
 		 443 aa  907    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  59.36 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  40.69 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  38.8 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  35.06 
 
 		 421 aa  245  9e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  35.06 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  34.74 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  34.24 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  32.73 
 
 		 437 aa  223  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  33.01 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  33.41 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  33.41 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  33.66 
 
 		 484 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  33.98 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.68 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  32.78 
 
 		 642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  32.45 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  32.93 
 
 		 497 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  30.84 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  30.36 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  32.12 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  28.78 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  28.36 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  30.09 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  31.11 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  30.21 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  26.83 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  35.44 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  27.86 
 
 		 892 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  29.67 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  34.53 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  34.96 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  28.95 
 
 		 1092 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  34.53 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.41 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  27.37 
 
 		 373 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  24.91 
 
 		 764 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  30.56 
 
 		 338 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  32.59 
 
 		 334 aa  94  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  33.8 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  32.26 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  28.05 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  30.94 
 
 		 326 aa  91.3  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  31.75 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  32.86 
 
 		 326 aa  90.5  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  34.74 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  31.78 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  32.13 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  30.26 
 
 		 322 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  27.57 
 
 		 330 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.96 
 
 		 322 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  27.8 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  30.63 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  27.1 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.86 
 
 		 1001 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  28.14 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  30.43 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.01 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  27.53 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  27.18 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.95 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  29 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.42 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.01 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.36 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  29.07 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  28.4 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  28.74 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  26.67 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  28.57 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  29.86 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  28.36 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  27.38 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  26.14 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  26.64 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  26.51 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  28.57 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  24.32 
 
 		 942 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  31.3 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  26.86 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  25.91 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  27.91 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  28.51 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  25.95 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  27.69 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  27.54 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  26.03 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  27.89 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  26.03 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  25.61 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  27.55 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  26.18 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  27.69 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  29.03 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  24.59 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  24.64 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  25.68 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  28.63 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  27.59 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>