More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  100 
 
 		 499 aa  970    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  70.34 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  66.67 
 
 		 484 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  60.93 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  63.8 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  59.75 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  68.23 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  58.82 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  59.63 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  67.42 
 
 		 473 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  62.88 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  62.98 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  55.1 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  60.71 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  64.95 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  61.7 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  62.47 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  67.13 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  63.81 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  58.63 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  58.63 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  58.63 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  60.37 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  60.71 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  60.87 
 
 		 502 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  58.61 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  60.3 
 
 		 465 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  60.42 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  60.05 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  61.73 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  63.09 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  58.08 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  57.97 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  57.54 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  62.15 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  60.26 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  61.14 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  56.42 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  51.39 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  46.28 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.45 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 450 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  48.31 
 
 		 435 aa  349  8e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  52.22 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  51.8 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  49.74 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.49 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 441 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  49.45 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  56.7 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  50.14 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  49.72 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  53.03 
 
 		 437 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  52.74 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  52.74 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  48.47 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  51.1 
 
 		 441 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  47.61 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  49.18 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.49 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  48.34 
 
 		 435 aa  323  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.38 
 
 		 437 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  46.65 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.63 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  49.1 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.03 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.73 
 
 		 739 aa  316  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.74 
 
 		 726 aa  315  9e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.31 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.03 
 
 		 447 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 447 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  48.5 
 
 		 432 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.9 
 
 		 422 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  53.78 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  48.16 
 
 		 423 aa  310  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  43.98 
 
 		 445 aa  309  5.9999999999999995e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  49.59 
 
 		 458 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.59 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  50.42 
 
 		 461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  42.9 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  50.83 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.08 
 
 		 731 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.44 
 
 		 733 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  44.54 
 
 		 426 aa  305  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  51.11 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  44.48 
 
 		 416 aa  304  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  43.49 
 
 		 428 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  50.14 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.15 
 
 		 721 aa  303  5.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  43.55 
 
 		 425 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.81 
 
 		 423 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  47.79 
 
 		 485 aa  302  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  45.29 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>