More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02969 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  100 
 
 
387 aa  797    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  55.68 
 
 
369 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  52.35 
 
 
363 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  44.84 
 
 
342 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  42.77 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  39.89 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  40.17 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  39.89 
 
 
315 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  37.64 
 
 
326 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  37.25 
 
 
325 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  39.82 
 
 
317 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  48.61 
 
 
373 aa  222  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  38.18 
 
 
315 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  37.97 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  36.72 
 
 
338 aa  219  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  49.07 
 
 
329 aa  219  5e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  37.54 
 
 
324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  35.84 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  46.3 
 
 
327 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  37.61 
 
 
348 aa  216  7e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  48.15 
 
 
329 aa  215  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  36.76 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  36.95 
 
 
330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  37.22 
 
 
322 aa  213  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  48.15 
 
 
328 aa  212  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  44.26 
 
 
398 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  36.39 
 
 
320 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  37.54 
 
 
322 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  35.6 
 
 
341 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  37.35 
 
 
319 aa  207  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  36.18 
 
 
321 aa  206  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  36.07 
 
 
326 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  44.34 
 
 
332 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  35.23 
 
 
330 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  37.35 
 
 
323 aa  202  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  49.06 
 
 
318 aa  199  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  35.13 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  36.88 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  34.97 
 
 
347 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  45.37 
 
 
349 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  35.08 
 
 
305 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  45.58 
 
 
289 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  36.36 
 
 
326 aa  189  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  45.16 
 
 
325 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  43.78 
 
 
334 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  42.47 
 
 
316 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  54.36 
 
 
940 aa  163  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  29.04 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  35.15 
 
 
336 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  30.99 
 
 
356 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  29 
 
 
340 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  30.51 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  30.68 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  32.61 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  30.33 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  31.28 
 
 
361 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  29.78 
 
 
331 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  28.28 
 
 
355 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.44 
 
 
807 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.38 
 
 
589 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  29.91 
 
 
352 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.05 
 
 
732 aa  97.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.8 
 
 
526 aa  95.5  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.36 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.82 
 
 
735 aa  93.6  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.93 
 
 
460 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.23 
 
 
627 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 
517 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  26.75 
 
 
669 aa  91.3  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.81 
 
 
550 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.12 
 
 
900 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.95 
 
 
534 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  28.82 
 
 
429 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  26.28 
 
 
579 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.39 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.24 
 
 
586 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.87 
 
 
501 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  31.39 
 
 
497 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.55 
 
 
695 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.24 
 
 
584 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.3 
 
 
546 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.5 
 
 
575 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.65 
 
 
602 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.82 
 
 
527 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.63 
 
 
595 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.29 
 
 
588 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.19 
 
 
606 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.51 
 
 
601 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.19 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  29.6 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.35 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.98 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.51 
 
 
601 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  30.43 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.22 
 
 
637 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  30 
 
 
483 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.05 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.52 
 
 
586 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.05 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  26.46 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>