105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38748 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  100 
 
 		 355 aa  738    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  47.4 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  46 
 
 		 352 aa  315  7e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  40.51 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  40.16 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  28.13 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  29.22 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.85 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  26.67 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  27.46 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  27.14 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  26.14 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  27.2 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  29.39 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  26.91 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  26.91 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  26.91 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  26.24 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  25.97 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.41 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  30.77 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  24.93 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  25.07 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  29.54 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.99 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  25.93 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  31.06 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  32.2 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  30.8 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.96 
 
 		 330 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  30.38 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  27.87 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  28.45 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  27.31 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.69 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  24.23 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  28.28 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  29.22 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  27.64 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  32.37 
 
 		 318 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.63 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  27.6 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  28.27 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  26.1 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.25 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  29.88 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  27.2 
 
 		 316 aa  93.2  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  25.07 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.36 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  24.79 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  36.53 
 
 		 940 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  28.46 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  33.2 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29.06 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.24 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  25.93 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.33 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  27.9 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.21 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  23.65 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  23.83 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  22.1 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  20.75 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  21.61 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 606 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 601 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 601 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.54 
 
 		 627 aa  53.1  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.56 
 
 		 606 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  31.31 
 
 		 955 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  25.33 
 
 		 565 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.3 
 
 		 1071 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_002978  WD1060  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  24.79 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  25.73 
 
 		 579 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.33 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.16 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0611  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.18 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.55 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0542  AAA ATPase  24.08 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.62 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  21.19 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  22.54 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.3 
 
 		 939 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  24.71 
 
 		 595 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  22.22 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02714  DNA polymerase III subunit delta'  26.32 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.29 
 
 		 921 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.3 
 
 		 1045 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.26 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0255  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.73 
 
 		 623 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  22.16 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.3 
 
 		 1040 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.28 
 
 		 914 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  24.67 
 
 		 584 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  21.59 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.27 
 
 		 505 aa  43.1  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.71 
 
 		 478 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.28 
 
 		 1137 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.71 
 
 		 478 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>