More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1868 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  100 
 
 		 334 aa  677    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  92.22 
 
 		 334 aa  605  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  63.96 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  63.36 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  66.36 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  31.58 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.67 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.27 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  29.17 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  32 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.9 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.24 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  31.56 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  31.56 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.64 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  29.52 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  29.67 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.79 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  28.66 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  26.35 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.43 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.06 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  29.81 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  30.23 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  30.58 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  28.24 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  27.16 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  26.92 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  29.15 
 
 		 319 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  32.14 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  30.3 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  30 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  29.05 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.76 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  26.73 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  27.33 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  29.47 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  27.57 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  26.85 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.74 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  28.24 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  26.57 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.23 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  27.59 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  34.36 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  25.37 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  25.91 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.33 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.81 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  26.07 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  27.12 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  27.38 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  29.84 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  29.38 
 
 		 940 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  29.95 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.85 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.63 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.91 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  23.08 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  26.35 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.08 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  26.28 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.27 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  28.06 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.42 
 
 		 594 aa  76.3  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.64 
 
 		 648 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.1 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.1 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  21.57 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.99 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  25.51 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.72 
 
 		 554 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  24.44 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.27 
 
 		 570 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.17 
 
 		 650 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.24 
 
 		 1078 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  25.82 
 
 		 559 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  25.39 
 
 		 955 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  25.86 
 
 		 575 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.41 
 
 		 642 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.68 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  27.09 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  28.62 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.3 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.73 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.14 
 
 		 728 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.81 
 
 		 735 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.75 
 
 		 501 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  29.41 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.02 
 
 		 729 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25 
 
 		 584 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  24.62 
 
 		 586 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  26.9 
 
 		 467 aa  69.3  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  24.56 
 
 		 579 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.21 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.86 
 
 		 939 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.2 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>