More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1247 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  100 
 
 		 340 aa  689    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  71.39 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  65.17 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  63.96 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  59.64 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  32.26 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.81 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  29.31 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31.46 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  27.7 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  32.01 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  31.61 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  27.99 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  27.99 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  27.99 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  30.1 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  28.78 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  27.65 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30.33 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.15 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  29.41 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.06 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  28.24 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.53 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  28.75 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  28.15 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  27.7 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  28.86 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.15 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  25.73 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  27.8 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  26.49 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  25.66 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  26.27 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  27.13 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  28.77 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  29.72 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  26.09 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  26.63 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  28.04 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.08 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  26.19 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  27.49 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  25.3 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.47 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.43 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.22 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  25 
 
 		 363 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  25.69 
 
 		 369 aa  89.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  25.52 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  31.49 
 
 		 940 aa  85.9  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  25.21 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  24.71 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  25.26 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.37 
 
 		 517 aa  82.4  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  24.68 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  23.61 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  24.09 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.68 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  25.1 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  28.63 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  26.56 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.69 
 
 		 553 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.77 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  25 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  25.66 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  22.1 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  22.78 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.14 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  26.27 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 648 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.74 
 
 		 730 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.8 
 
 		 602 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  21.62 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.11 
 
 		 634 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  31.25 
 
 		 577 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 724 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  23.02 
 
 		 575 aa  65.9  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.17 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.7 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.57 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.6 
 
 		 658 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.2 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.7 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.43 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  25.61 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.6 
 
 		 658 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.6 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.61 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>