More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0240 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  100 
 
 		 316 aa  640    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  46.35 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  45.98 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  46.47 
 
 		 330 aa  281  7.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  46.79 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  46.33 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  45.86 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  46.01 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  45.82 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  46.33 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  47.88 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  45.69 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  45.19 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  43.27 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  41.99 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  42.95 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  39.81 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  42.31 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  41.35 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  40.19 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  39.16 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  39.74 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  40.32 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  39.87 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  42.81 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  39.42 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  40.58 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  36.89 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  40.4 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  36.81 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  38.49 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  37.54 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  44.18 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  39.12 
 
 		 347 aa  202  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  41.98 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  40.79 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  35.39 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  42.46 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  45.37 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  44.5 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  34.64 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  39.76 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  42.47 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  35.69 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  37.83 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  33.33 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  55.3 
 
 		 940 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  32.16 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  28.66 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  28.11 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  29.09 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  27.68 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  26.43 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  27.46 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  26.84 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  25.15 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  31.56 
 
 		 483 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  26.63 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  27.89 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.85 
 
 		 632 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  27.2 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  31.53 
 
 		 481 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 478 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  26.59 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.93 
 
 		 518 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  31.88 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.24 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  26.87 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.24 
 
 		 496 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  28.9 
 
 		 579 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  26.57 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.21 
 
 		 455 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.45 
 
 		 548 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.06 
 
 		 517 aa  96.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.52 
 
 		 586 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.63 
 
 		 540 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  25.93 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  30.05 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  29.89 
 
 		 497 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.55 
 
 		 584 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  30.04 
 
 		 642 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  27.95 
 
 		 418 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.9 
 
 		 594 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.9 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.46 
 
 		 546 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.68 
 
 		 447 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.65 
 
 		 510 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  30.37 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.23 
 
 		 595 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.84 
 
 		 462 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  26.67 
 
 		 363 aa  90.1  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  30.19 
 
 		 497 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.75 
 
 		 562 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  29.74 
 
 		 349 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.31 
 
 		 627 aa  89.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.63 
 
 		 505 aa  89.4  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.547641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.29 
 
 		 518 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  28.23 
 
 		 381 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>