More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0442 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
546 aa  1118    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  55.13 
 
 
543 aa  579  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.75 
 
 
553 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.12 
 
 
554 aa  511  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0571  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54.53 
 
 
509 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.337724  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.44 
 
 
529 aa  495  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.23 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.23 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  49 
 
 
526 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.31 
 
 
510 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.38 
 
 
893 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 
957 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.09 
 
 
911 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.82 
 
 
821 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.38 
 
 
793 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.38 
 
 
793 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.82 
 
 
813 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.82 
 
 
824 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.54 
 
 
791 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.92 
 
 
1137 aa  300  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.46 
 
 
948 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  48.46 
 
 
572 aa  299  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.1 
 
 
787 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.1 
 
 
787 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.09 
 
 
543 aa  299  9e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.09 
 
 
601 aa  299  9e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50 
 
 
681 aa  299  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
812 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
825 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
825 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
825 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
825 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.15 
 
 
1115 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
822 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
826 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.37 
 
 
659 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.97 
 
 
692 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.27 
 
 
698 aa  296  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.77 
 
 
1137 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.94 
 
 
957 aa  296  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.97 
 
 
687 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.97 
 
 
689 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.87 
 
 
825 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.97 
 
 
691 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.38 
 
 
1147 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  47.29 
 
 
955 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.3 
 
 
743 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.3 
 
 
736 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.45 
 
 
582 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.64 
 
 
551 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
642 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
642 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
642 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
642 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.77 
 
 
582 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.48 
 
 
565 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.79 
 
 
642 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.1 
 
 
642 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.19 
 
 
584 aa  291  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.03 
 
 
667 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
1040 aa  291  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
1113 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
1071 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
1045 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.96 
 
 
696 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.37 
 
 
939 aa  289  7e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  47.42 
 
 
579 aa  289  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.77 
 
 
582 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.72 
 
 
716 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.06 
 
 
690 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.28 
 
 
694 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  49.82 
 
 
696 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.42 
 
 
579 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
921 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  49.06 
 
 
1002 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.28 
 
 
553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.75 
 
 
643 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.63 
 
 
582 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.43 
 
 
774 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.46 
 
 
795 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.37 
 
 
728 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.95 
 
 
692 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.95 
 
 
681 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.24 
 
 
723 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.71 
 
 
701 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.1 
 
 
569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.25 
 
 
591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.42 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50 
 
 
580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.91 
 
 
730 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.26 
 
 
637 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>