More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0470 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  100 
 
 		 467 aa  953    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  49.17 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  45.05 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  47.74 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  45.31 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  43.02 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  44.93 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  41.74 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  40.66 
 
 		 454 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  39.32 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  39.29 
 
 		 476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  39.95 
 
 		 451 aa  308  9e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  41.33 
 
 		 437 aa  299  9e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  41.82 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.93 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  39.27 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  38.73 
 
 		 482 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  38.3 
 
 		 474 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  38.24 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.32 
 
 		 413 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  35.49 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  35.58 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  36.59 
 
 		 422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  35.29 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.68 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  33.33 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.35 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  28.78 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  26.51 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  28.34 
 
 		 892 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  36.36 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  35.85 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  32.76 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  32.93 
 
 		 329 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  35.41 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.39 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  35.1 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  32.01 
 
 		 348 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.75 
 
 		 322 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.57 
 
 		 325 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.39 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  35.55 
 
 		 330 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  33.18 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  34.45 
 
 		 326 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  31.9 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  31.28 
 
 		 1092 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  31.43 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  30.42 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  29.71 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  35.55 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  32.23 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  32.7 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  27.31 
 
 		 1001 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  33.33 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  36.99 
 
 		 318 aa  97.8  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  30.94 
 
 		 347 aa  97.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  31.58 
 
 		 942 aa  96.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  32.06 
 
 		 322 aa  96.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  32.86 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.7 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  30.88 
 
 		 315 aa  94  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  30.17 
 
 		 369 aa  94  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  32.75 
 
 		 363 aa  93.6  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  32.39 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  30.04 
 
 		 764 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.52 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  30.33 
 
 		 332 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  31.46 
 
 		 349 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  31.92 
 
 		 322 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  30.81 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  28.44 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  30.32 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.81 
 
 		 315 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  31.96 
 
 		 322 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  34.3 
 
 		 305 aa  87.4  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.81 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  29.86 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  30.37 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  30.99 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  30.57 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  33.12 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  26.89 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  29.05 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  25.23 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  25.56 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  29.03 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.61 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  28.11 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  28.11 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  26.75 
 
 		 739 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  29.61 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  25.37 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  25.71 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  28.5 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  28.04 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  28.04 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1825  recombination factor protein RarA  27.6 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  27.6 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  26.57 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>