More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1361 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  100 
 
 		 474 aa  959    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  57.8 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  57.76 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  58.21 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  54.79 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  40.68 
 
 		 642 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  36.97 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  38.02 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  38.3 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  37.84 
 
 		 497 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  38.39 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  38.24 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  38.16 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  33.88 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  37.23 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  35.81 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  34.36 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  34.13 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  35.88 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  35.64 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  35 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  34.21 
 
 		 500 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  35.89 
 
 		 421 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  30.79 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  33.98 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  34.42 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  29.81 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  29.18 
 
 		 892 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  24.67 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  30.63 
 
 		 942 aa  106  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  29.75 
 
 		 1001 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  32.13 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  31.36 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  30.94 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.13 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.55 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  29.78 
 
 		 326 aa  99.8  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  29.39 
 
 		 334 aa  97.8  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.97 
 
 		 764 aa  96.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  33.19 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  27.71 
 
 		 1092 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  30.37 
 
 		 328 aa  94.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  33.19 
 
 		 315 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  33.19 
 
 		 315 aa  93.2  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  29.25 
 
 		 319 aa  93.2  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  33.02 
 
 		 315 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  31.55 
 
 		 322 aa  90.9  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  29.68 
 
 		 342 aa  90.5  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  29.87 
 
 		 347 aa  90.1  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  30.04 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.17 
 
 		 398 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.15 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  27.68 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.12 
 
 		 322 aa  88.2  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.96 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  30.52 
 
 		 320 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  29.44 
 
 		 324 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  29.44 
 
 		 326 aa  87.8  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  31.08 
 
 		 317 aa  87.4  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  30.33 
 
 		 329 aa  87  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  29.91 
 
 		 338 aa  86.7  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.63 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.28 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  29.58 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.67 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.7 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  26.92 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  30.14 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.28 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.2 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.96 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  42.24 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  23.58 
 
 		 235 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.07 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.77 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  27.49 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  31.39 
 
 		 316 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  30.37 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  25.47 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  26.07 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  21.76 
 
 		 993 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  28.74 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.14 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.05 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  30.29 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  27.27 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  24.62 
 
 		 1015 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  26.73 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.81 
 
 		 570 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05617  DNA replication ATPase (Eurofung)  27.23 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00143305  normal  0.0551147 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  28.38 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  25.86 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  26.48 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  26.41 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  27.94 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  28.51 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>