More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2075 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  100 
 
 		 642 aa  1317    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  58.75 
 
 		 497 aa  612  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  49.17 
 
 		 467 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  43.76 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  44.5 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  43.74 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  43.21 
 
 		 497 aa  363  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  42.89 
 
 		 483 aa  319  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  40.21 
 
 		 476 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  39.91 
 
 		 500 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  41.51 
 
 		 481 aa  299  9e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  39.8 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  39.85 
 
 		 484 aa  294  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  39.12 
 
 		 482 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  41.11 
 
 		 454 aa  293  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  39.47 
 
 		 492 aa  292  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  40.38 
 
 		 474 aa  289  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  39.72 
 
 		 451 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  38.63 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.5 
 
 		 413 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  32.7 
 
 		 422 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  33.58 
 
 		 418 aa  218  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  32.23 
 
 		 423 aa  213  9e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  31.83 
 
 		 421 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  31.75 
 
 		 422 aa  205  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  34.86 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.78 
 
 		 443 aa  197  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  30.6 
 
 		 385 aa  134  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  27.36 
 
 		 498 aa  132  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  28.4 
 
 		 1001 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  33.47 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  32.34 
 
 		 1092 aa  110  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  33.18 
 
 		 324 aa  110  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  34.88 
 
 		 320 aa  110  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  32.19 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  32.73 
 
 		 322 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  34.26 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  34.12 
 
 		 349 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  34.08 
 
 		 322 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  34.6 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  33.64 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  35.24 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  33.21 
 
 		 325 aa  105  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  34.72 
 
 		 329 aa  105  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.89 
 
 		 329 aa  104  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  34.43 
 
 		 334 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  33.33 
 
 		 322 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  33.64 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  31.13 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  28.03 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  30.74 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  33.49 
 
 		 328 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  33.02 
 
 		 315 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  31.75 
 
 		 373 aa  97.8  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.2 
 
 		 892 aa  97.4  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  30.37 
 
 		 289 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  32.55 
 
 		 347 aa  96.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  33.33 
 
 		 317 aa  97.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  32.09 
 
 		 315 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.25 
 
 		 315 aa  94.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.89 
 
 		 318 aa  94.4  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  29.66 
 
 		 942 aa  94  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  31.16 
 
 		 315 aa  93.6  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.54 
 
 		 326 aa  92.8  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  30.18 
 
 		 338 aa  92.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  30.91 
 
 		 330 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  30.04 
 
 		 316 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  28.95 
 
 		 369 aa  89.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  30.14 
 
 		 323 aa  87.8  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.57 
 
 		 325 aa  86.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  31.44 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  31.6 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  30.09 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.64 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.36 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.91 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  27.14 
 
 		 334 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  30.66 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.8 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  23.59 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  29.33 
 
 		 1015 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.7 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.65 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.36 
 
 		 540 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  25.56 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  25.64 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  22.35 
 
 		 993 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  26.87 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  25.64 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.73 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  27.72 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  34.4 
 
 		 940 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  23.86 
 
 		 336 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  21.02 
 
 		 571 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.23 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.21 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31.18 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  28.39 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.42 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>