More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1233 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  100 
 
 		 336 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  56.63 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  56.93 
 
 		 332 aa  381  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  48.04 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  38.15 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  32.94 
 
 		 340 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  35.82 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.45 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  35.05 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  34.32 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  32.94 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  33.63 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  34.64 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.52 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  33.93 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  34.05 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  34.34 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  32.73 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.63 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  33.24 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  32.44 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  34.22 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  33.13 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  34.35 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  33.96 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  31.14 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  31.55 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.94 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.25 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.63 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.53 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  32.41 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  29.85 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  29.67 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  29.17 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  31.82 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  35.27 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  28.23 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  29.67 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.83 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  34.09 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  30.55 
 
 		 363 aa  126  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  33.64 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  34.2 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  30.21 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  35.15 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  28.36 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  30.49 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.15 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  26.65 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  33.78 
 
 		 940 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  35.4 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  27.66 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  28.95 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  28.49 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  30.17 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  28.45 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.83 
 
 		 478 aa  97.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.83 
 
 		 478 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.49 
 
 		 589 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  28.19 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 		 462 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  28.93 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.89 
 
 		 526 aa  89.4  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.31 
 
 		 575 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.39 
 
 		 529 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.83 
 
 		 582 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.72 
 
 		 562 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.05 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 517 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.97 
 
 		 562 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.22 
 
 		 732 aa  85.9  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.72 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.34 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.7 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  23.97 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.7 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  31.42 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.7 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  28.31 
 
 		 807 aa  83.2  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.56 
 
 		 893 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 632 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.36 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.01 
 
 		 735 aa  82.8  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.56 
 
 		 793 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  29.17 
 
 		 429 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.3 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  28.05 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.65 
 
 		 559 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.25 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  30.09 
 
 		 957 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>