More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0243 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
478 aa  967    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  98.74 
 
 
478 aa  956    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.06 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.91 
 
 
517 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.95 
 
 
467 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.48 
 
 
540 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.94 
 
 
554 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.72 
 
 
589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.88 
 
 
565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.88 
 
 
565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.61 
 
 
527 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.52 
 
 
559 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.09 
 
 
562 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  49.82 
 
 
568 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.53 
 
 
561 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.98 
 
 
586 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
562 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 
499 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51.93 
 
 
550 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.11 
 
 
534 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.79 
 
 
589 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.43 
 
 
447 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.02 
 
 
496 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.19 
 
 
547 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.3 
 
 
501 aa  292  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.76 
 
 
427 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.64 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.18 
 
 
567 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.18 
 
 
602 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.15 
 
 
518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 
591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  47.39 
 
 
548 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.36 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.18 
 
 
554 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
569 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.47 
 
 
582 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.23 
 
 
518 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  41.48 
 
 
396 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.06 
 
 
522 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.6 
 
 
455 aa  280  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.19 
 
 
579 aa  279  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.5 
 
 
735 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.4 
 
 
395 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  49.45 
 
 
807 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  45.23 
 
 
602 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.12 
 
 
588 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  49.82 
 
 
900 aa  276  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.08 
 
 
550 aa  276  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.03 
 
 
551 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.1 
 
 
553 aa  276  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.25 
 
 
570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  45.26 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.16 
 
 
682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.39 
 
 
688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  46.49 
 
 
629 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.32 
 
 
606 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.62 
 
 
622 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.28 
 
 
649 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.06 
 
 
562 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.57 
 
 
582 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
547 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
547 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  46.55 
 
 
559 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  40.06 
 
 
537 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.14 
 
 
599 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.71 
 
 
774 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  41.52 
 
 
648 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
690 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.76 
 
 
421 aa  270  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  42.28 
 
 
955 aa  269  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  47.31 
 
 
577 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.91 
 
 
553 aa  269  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.94 
 
 
692 aa  269  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.48 
 
 
694 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.97 
 
 
579 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.95 
 
 
632 aa  269  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.4 
 
 
914 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.23 
 
 
701 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.29 
 
 
732 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.2 
 
 
681 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  45.82 
 
 
562 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  45.55 
 
 
580 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.3 
 
 
647 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.74 
 
 
611 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.67 
 
 
579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.61 
 
 
601 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.48 
 
 
690 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.04 
 
 
627 aa  267  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.61 
 
 
601 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.82 
 
 
570 aa  267  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  45.04 
 
 
625 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>