More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1664 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  100 
 
 		 331 aa  682    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  56.79 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  56.63 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  48.19 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  38.07 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  34.43 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  31.49 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  31.42 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.82 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  30.29 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.51 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  31.87 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  32.42 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  32.95 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.85 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.93 
 
 		 328 aa  149  8e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.95 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.07 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.96 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  30.91 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  33.03 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  30.75 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.68 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.18 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  29.39 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.88 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  30.77 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  30.18 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31.01 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  30.8 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  28.45 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  32.01 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  30.3 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  32.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.29 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  30.8 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  31.01 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  30.84 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.4 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  32.02 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  30.57 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  34.05 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  28.04 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  27.63 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  26.05 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  30.19 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  25.29 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  29.81 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  30.81 
 
 		 940 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  29.78 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  30.83 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  32.77 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.39 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  29.63 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  24.08 
 
 		 369 aa  99.8  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  30.36 
 
 		 363 aa  99.4  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.69 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  29.15 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  25.17 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  28.02 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  24.75 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.45 
 
 		 562 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  28.46 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.51 
 
 		 462 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.03 
 
 		 517 aa  85.9  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  29.44 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  30.51 
 
 		 577 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.63 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.44 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.18 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.2 
 
 		 688 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.02 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.45 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.14 
 
 		 695 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.66 
 
 		 588 aa  82.4  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  31.09 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.14 
 
 		 1002 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  27.68 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.34 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.22 
 
 		 732 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.34 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  29 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.66 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.28 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.07 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.63 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.18 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  25.86 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.36 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>