More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1674 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  100 
 
 		 322 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  77.64 
 
 		 322 aa  507  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  74.76 
 
 		 326 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  71.65 
 
 		 323 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  69.91 
 
 		 321 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  55.73 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  53.87 
 
 		 334 aa  359  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  56.48 
 
 		 305 aa  352  5e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  51.79 
 
 		 315 aa  351  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  50.81 
 
 		 315 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  51.47 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  53.87 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  50.81 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  55.63 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  53.23 
 
 		 330 aa  346  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  53.23 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  56.15 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  46.84 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  47.06 
 
 		 326 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  45 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  45.14 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  45.43 
 
 		 348 aa  285  5.999999999999999e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  45.45 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  45.77 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  45.51 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  45.19 
 
 		 318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  43.87 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  43.55 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  42.9 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  38.92 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  42.63 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  42.26 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  39.94 
 
 		 342 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.8 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  41.16 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  39.16 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  39.87 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  40.89 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  37.66 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  43.6 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  39.58 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  34.2 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  34.91 
 
 		 398 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  36.2 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  37.14 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  63.91 
 
 		 940 aa  199  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  35.13 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  34.9 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  31.94 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.24 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  32.66 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  31.55 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  30.91 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  28.28 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  29.34 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  28.13 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  28.9 
 
 		 361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  27.4 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 601 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 601 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 		 606 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 		 614 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.9 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  26.93 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.79 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 605 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 		 701 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 		 606 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.88 
 
 		 695 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 		 678 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.67 
 
 		 679 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  29.63 
 
 		 600 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.74 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0515  DNA polymerase subunits gamma and tau  30.21 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  29.21 
 
 		 625 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.06 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.23 
 
 		 589 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 664 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.26 
 
 		 554 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.57 
 
 		 548 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.89 
 
 		 731 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.37 
 
 		 427 aa  99.4  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.04 
 
 		 604 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  28.37 
 
 		 669 aa  98.6  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  27.08 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.34 
 
 		 569 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  28 
 
 		 614 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  26.16 
 
 		 650 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2268  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.78 
 
 		 610 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  30.52 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  29.69 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  27.42 
 
 		 396 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.56 
 
 		 647 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.68 
 
 		 634 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.8 
 
 		 529 aa  96.7  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 629 aa  95.9  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2330  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.44 
 
 		 620 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.41 
 
 		 863 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  28.67 
 
 		 614 aa  95.9  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  29.39 
 
 		 652 aa  95.9  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>