More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0994 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  100 
 
 		 323 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  72.78 
 
 		 322 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  71.65 
 
 		 322 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  68.17 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  64.58 
 
 		 321 aa  431  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  55.48 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  57.67 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  53.55 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  55.14 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  53.55 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  56.04 
 
 		 305 aa  358  8e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  51.79 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  52.12 
 
 		 315 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  51.14 
 
 		 315 aa  354  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  51.79 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  50.32 
 
 		 317 aa  348  9e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  55.81 
 
 		 327 aa  345  8e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  45.89 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  45.89 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  43.65 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  45.05 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  43.22 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  45.37 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  44.78 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  44.12 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  43.46 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  44.12 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  42.24 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  44.52 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  43.14 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  43.08 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  41.03 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  37.79 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  41.53 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  41.35 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  36.28 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  36.89 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  40.13 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  35.39 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  36.23 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  34.42 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  42.06 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  37.35 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  33.23 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  36.05 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  61.65 
 
 		 940 aa  193  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  34.12 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  31.36 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  32.04 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  28.99 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  32.83 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  32.65 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  29.39 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  32.48 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  27.17 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  27.45 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  26.14 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  25.71 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.01 
 
 		 462 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.73 
 
 		 732 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  29.25 
 
 		 669 aa  102  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  27.16 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.53 
 
 		 517 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  27.06 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 527 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.63 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  33.02 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.55 
 
 		 496 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  31.9 
 
 		 575 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  32.24 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  25 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.1 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.23 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.56 
 
 		 735 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 		 569 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.31 
 
 		 589 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.43 
 
 		 447 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.88 
 
 		 520 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.93 
 
 		 546 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.73 
 
 		 755 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.11 
 
 		 614 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  25.34 
 
 		 526 aa  97.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  25.3 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl678  DNA polymerase III gamma and tau subunits  29.06 
 
 		 631 aa  96.7  5e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.11 
 
 		 701 aa  96.3  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 678 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  29.54 
 
 		 483 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  30.77 
 
 		 481 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.56 
 
 		 540 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.3 
 
 		 695 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.92 
 
 		 679 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  26.28 
 
 		 652 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  31.84 
 
 		 600 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.02 
 
 		 421 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 		 499 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.5 
 
 		 395 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 589 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  24.57 
 
 		 650 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.57 
 
 		 663 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.02 
 
 		 602 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>