More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39197 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  100 
 
 
334 aa  690    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  60.9 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  56.86 
 
 
349 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  54.26 
 
 
325 aa  358  7e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  64.06 
 
 
289 aa  344  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  44.94 
 
 
326 aa  263  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  45.05 
 
 
330 aa  259  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  43.95 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  42.63 
 
 
322 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  41.03 
 
 
315 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  41.9 
 
 
326 aa  246  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  41.67 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  40.44 
 
 
334 aa  245  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  41.03 
 
 
315 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  41.35 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  39.27 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  39.23 
 
 
330 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  41.03 
 
 
323 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  38.26 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  40.99 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  40.79 
 
 
327 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  40.38 
 
 
321 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  38.59 
 
 
341 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  42.01 
 
 
320 aa  236  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  42.44 
 
 
317 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  41.14 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  40.57 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  40.82 
 
 
322 aa  232  6e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  42.77 
 
 
318 aa  228  8e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  39.54 
 
 
373 aa  226  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  41.16 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  40.6 
 
 
305 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  42.32 
 
 
338 aa  212  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  38.54 
 
 
329 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  38.63 
 
 
328 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  39.2 
 
 
329 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  38.44 
 
 
326 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  35.21 
 
 
398 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  47.66 
 
 
363 aa  192  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  40.82 
 
 
332 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  36.56 
 
 
350 aa  189  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  37.73 
 
 
322 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  43.78 
 
 
387 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  40.07 
 
 
342 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  34.62 
 
 
369 aa  186  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  39.76 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  44.38 
 
 
940 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  29.67 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  28.45 
 
 
356 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  31.37 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  32.3 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  28.78 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  27.58 
 
 
363 aa  116  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  32.02 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.03 
 
 
481 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  33.18 
 
 
467 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  27.43 
 
 
352 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  34.43 
 
 
642 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  30.87 
 
 
332 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 
497 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  24.83 
 
 
579 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  29.17 
 
 
349 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  29.25 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.97 
 
 
594 aa  99.4  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  32.54 
 
 
514 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.69 
 
 
361 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  29.39 
 
 
474 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.76 
 
 
565 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  32.74 
 
 
483 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.76 
 
 
565 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  27.49 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  26.87 
 
 
361 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.17 
 
 
580 aa  97.4  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.11 
 
 
568 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  26.62 
 
 
600 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  23.83 
 
 
586 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.07 
 
 
546 aa  96.3  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.04 
 
 
478 aa  96.3  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  29.96 
 
 
418 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  27.91 
 
 
575 aa  95.9  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.49 
 
 
589 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  31.12 
 
 
507 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.87 
 
 
807 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  24.75 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  29.44 
 
 
499 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.41 
 
 
478 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  26.61 
 
 
595 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.17 
 
 
627 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.59 
 
 
443 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  27.38 
 
 
451 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  33.18 
 
 
454 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.96 
 
 
735 aa  93.6  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  32.14 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  23.49 
 
 
584 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  31.25 
 
 
497 aa  92.8  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  27.38 
 
 
413 aa  92.8  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.18 
 
 
510 aa  92.4  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  30.34 
 
 
572 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.3 
 
 
900 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>