More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4530 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
361 aa  743    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  80.11 
 
 
600 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  75.49 
 
 
569 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.88 
 
 
621 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  59.94 
 
 
602 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  59.07 
 
 
381 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.22 
 
 
664 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  57.72 
 
 
629 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.04 
 
 
634 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  53.3 
 
 
602 aa  369  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.3 
 
 
610 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
547 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
547 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.24 
 
 
732 aa  272  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
617 aa  272  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.91 
 
 
522 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.57 
 
 
562 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  41.02 
 
 
396 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.57 
 
 
562 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.53 
 
 
562 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  41.73 
 
 
396 aa  269  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.53 
 
 
562 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.53 
 
 
562 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.53 
 
 
562 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.53 
 
 
562 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.24 
 
 
562 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.09 
 
 
562 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.96 
 
 
562 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.44 
 
 
398 aa  262  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.24 
 
 
562 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
606 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.48 
 
 
401 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.72 
 
 
551 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.96 
 
 
562 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39.55 
 
 
579 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.26 
 
 
599 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.46 
 
 
567 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.17 
 
 
579 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.22 
 
 
589 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  43.42 
 
 
625 aa  256  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.21 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.14 
 
 
561 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.21 
 
 
602 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.17 
 
 
559 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.89 
 
 
534 aa  252  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.12 
 
 
582 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.72 
 
 
582 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.89 
 
 
570 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  38.55 
 
 
650 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  42.43 
 
 
614 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.56 
 
 
569 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39 
 
 
579 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.55 
 
 
601 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.55 
 
 
601 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.2 
 
 
663 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  44.1 
 
 
559 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  40.51 
 
 
568 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  47.87 
 
 
575 aa  247  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.84 
 
 
565 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.84 
 
 
565 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.55 
 
 
606 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.43 
 
 
554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.49 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  38.5 
 
 
499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.94 
 
 
648 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.76 
 
 
570 aa  242  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.94 
 
 
650 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  42.43 
 
 
604 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  39 
 
 
582 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.98 
 
 
540 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.1 
 
 
550 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.06 
 
 
562 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.69 
 
 
644 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.9 
 
 
730 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  38.64 
 
 
652 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.54 
 
 
735 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.39 
 
 
547 aa  238  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.92 
 
 
695 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  41.88 
 
 
578 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.35 
 
 
602 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.67 
 
 
649 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.35 
 
 
602 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.94 
 
 
755 aa  236  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.33 
 
 
395 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.56 
 
 
550 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
632 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.37 
 
 
518 aa  235  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.84 
 
 
611 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
622 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.47 
 
 
627 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4575  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.41 
 
 
632 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  38.75 
 
 
548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.01 
 
 
589 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.14 
 
 
518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.53 
 
 
623 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.35 
 
 
605 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.06 
 
 
600 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.09 
 
 
627 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.42 
 
 
624 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.41 
 
 
623 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>