More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9547 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  100 
 
 		 350 aa  720    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  44.54 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  47.21 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  45.03 
 
 		 369 aa  295  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  42.9 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  42.22 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  40.36 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  39.56 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  42.49 
 
 		 329 aa  232  9e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  38.82 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  41.93 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  40.95 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  37.54 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  41.46 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  39.74 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  39.24 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  39.25 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  38.85 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  39.05 
 
 		 320 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  39.41 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  38.85 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  39.75 
 
 		 318 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  38.29 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  38.17 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  38.49 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  38.49 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  36.28 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  36.67 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  37.14 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  37.14 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  38.33 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  35.35 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  36.11 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  38.44 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  36.05 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  34.92 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  36.02 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  40.26 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  35.42 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  40.79 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  36.56 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  35.22 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  35.09 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  40.08 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  36.45 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  35.87 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  50.34 
 
 		 940 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  31.7 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  28.61 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  27.75 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  29.57 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  28.97 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  25.15 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  24.84 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  27.52 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.93 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.49 
 
 		 589 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.46 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  35.21 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.02 
 
 		 627 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  35.32 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.18 
 
 		 478 aa  95.9  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  28.02 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.77 
 
 		 567 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.33 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  26.55 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  27.19 
 
 		 669 aa  92.4  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.41 
 
 		 569 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  31.75 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.86 
 
 		 529 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.43 
 
 		 517 aa  89.7  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.62 
 
 		 589 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.92 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  27.4 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.04 
 
 		 601 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.04 
 
 		 601 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.14 
 
 		 606 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.71 
 
 		 588 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.03 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.86 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1410  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.67 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  23.03 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  31.6 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0830  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.11 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.96 
 
 		 737 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.95 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 735 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  34.36 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.51 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  23.97 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  29.86 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.44 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  27.71 
 
 		 807 aa  84  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.19 
 
 		 732 aa  83.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  22.97 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  26.79 
 
 		 629 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.83 
 
 		 755 aa  83.2  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  29.25 
 
 		 900 aa  83.2  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1334  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.4 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.41 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>