More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2444 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
567 aa  1111    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.83 
 
 
540 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.36 
 
 
547 aa  350  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.91 
 
 
589 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.76 
 
 
588 aa  346  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.85 
 
 
562 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.57 
 
 
562 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.92 
 
 
562 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.57 
 
 
562 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.77 
 
 
550 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.8 
 
 
589 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.45 
 
 
562 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.9 
 
 
562 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.18 
 
 
562 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.26 
 
 
561 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.45 
 
 
562 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.52 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.61 
 
 
562 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.45 
 
 
562 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.6 
 
 
559 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.11 
 
 
522 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.37 
 
 
579 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.87 
 
 
562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.86 
 
 
534 aa  326  9e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 
499 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57 
 
 
447 aa  324  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  50.31 
 
 
559 aa  323  5e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.75 
 
 
570 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  48.74 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.55 
 
 
582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.68 
 
 
554 aa  321  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.47 
 
 
599 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  44.42 
 
 
582 aa  320  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.76 
 
 
518 aa  319  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.91 
 
 
551 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.86 
 
 
518 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
732 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.93 
 
 
579 aa  316  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  43.19 
 
 
900 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.09 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.25 
 
 
565 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.25 
 
 
565 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.39 
 
 
735 aa  309  9e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.31 
 
 
582 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.88 
 
 
644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.4 
 
 
527 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.12 
 
 
579 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.18 
 
 
550 aa  306  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.38 
 
 
613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.29 
 
 
649 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.17 
 
 
755 aa  305  1.0000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.34 
 
 
611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.75 
 
 
569 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.53 
 
 
570 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.38 
 
 
568 aa  303  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.61 
 
 
547 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.61 
 
 
547 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  43.16 
 
 
807 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.98 
 
 
602 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.6 
 
 
612 aa  299  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.12 
 
 
682 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.95 
 
 
520 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.49 
 
 
724 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.6 
 
 
715 aa  296  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  44.17 
 
 
650 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.97 
 
 
610 aa  294  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.31 
 
 
732 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.32 
 
 
586 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.93 
 
 
395 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.23 
 
 
690 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.32 
 
 
578 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.6 
 
 
743 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  46.38 
 
 
614 aa  291  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.18 
 
 
478 aa  291  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.18 
 
 
478 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.78 
 
 
663 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.45 
 
 
578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.9 
 
 
634 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.08 
 
 
729 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.81 
 
 
455 aa  288  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  40.67 
 
 
602 aa  288  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.09 
 
 
834 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.04 
 
 
812 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.22 
 
 
632 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  47.96 
 
 
625 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.24 
 
 
575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.41 
 
 
808 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34 
 
 
606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.36 
 
 
692 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.01 
 
 
622 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.04 
 
 
863 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.4 
 
 
617 aa  283  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.09 
 
 
467 aa  282  9e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  48.51 
 
 
577 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  42.7 
 
 
652 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  39.38 
 
 
381 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.8 
 
 
560 aa  281  2e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  37.5 
 
 
548 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.27 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.04 
 
 
621 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>