More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0695 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  100 
 
 		 319 aa  647    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  90.94 
 
 		 320 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  86.48 
 
 		 322 aa  578  1e-164  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  86.71 
 
 		 324 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  64.15 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  64.88 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  63.14 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  62.5 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  57.1 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  56.48 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  53.97 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  50 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  51.27 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  48.21 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  48.05 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  46.58 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  47.56 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  43.37 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  43.46 
 
 		 330 aa  268  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  44.63 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  42.81 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  46.18 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  43.14 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  44.03 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  44.37 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  43.39 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  42.68 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  42.26 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  43.38 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  42.21 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  40.57 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  43.14 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  39.53 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  46.47 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  41.35 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  39.74 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  37.78 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  40.73 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  41.7 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  40.29 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  38.05 
 
 		 369 aa  208  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  37.35 
 
 		 387 aa  206  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  45.83 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  34.31 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  49.26 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  57.25 
 
 		 940 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  33.56 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  33.44 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  34.22 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  33.85 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  30.63 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  29.22 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  29.38 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  38.22 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  33.89 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  33.2 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.97 
 
 		 517 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.65 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  35.78 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.88 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  33.47 
 
 		 451 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.27 
 
 		 478 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.03 
 
 		 518 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  30.31 
 
 		 575 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  36.77 
 
 		 418 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  31.99 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.76 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  25.93 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  33.5 
 
 		 481 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  29.21 
 
 		 568 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  34.26 
 
 		 642 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.22 
 
 		 632 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  32.42 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  31.8 
 
 		 497 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.93 
 
 		 755 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  30.17 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.71 
 
 		 529 aa  106  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  31.68 
 
 		 500 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  27.8 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  31.84 
 
 		 497 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.94 
 
 		 548 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  30.08 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  30.68 
 
 		 582 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  34.02 
 
 		 454 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.09 
 
 		 589 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  28.22 
 
 		 579 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  28.47 
 
 		 669 aa  103  5e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  26.94 
 
 		 602 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.62 
 
 		 547 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.05 
 
 		 550 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  34.96 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.08 
 
 		 579 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.18 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.08 
 
 		 582 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  29.27 
 
 		 526 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.34 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.34 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  29.96 
 
 		 807 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  32.52 
 
 		 492 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>