More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0850 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  100 
 
 		 340 aa  692    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  55.88 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  35.96 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  33.82 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  34.9 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  35.19 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  31.86 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  34.9 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  35.28 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  31.27 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  32.93 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  32.84 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  32.57 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  33.43 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  32.23 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  35.42 
 
 		 322 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  33.53 
 
 		 332 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  32.94 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  34.9 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  33.24 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  33.63 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  33.04 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  33.14 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  33.94 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  31.36 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  33.72 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  33.23 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  33.53 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  31.49 
 
 		 331 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.56 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  33.89 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  33.79 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.45 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  30.95 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  30.41 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  32.87 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  28.53 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.12 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.46 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  30.68 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  29.31 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  32.16 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  30.41 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  31.7 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  31.58 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  28.44 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.84 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0051  Replication factor C  31.25 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.86 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.29 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  29 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  35.64 
 
 		 940 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.37 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  32.02 
 
 		 289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  30.29 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  30.17 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  32.24 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  33.62 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  30.13 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  29.82 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  25.07 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  28.52 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  30.73 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  25.91 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.31 
 
 		 834 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  26.87 
 
 		 727 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.87 
 
 		 808 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.37 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  27.31 
 
 		 1122 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.31 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.44 
 
 		 765 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.76 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.87 
 
 		 863 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.82 
 
 		 855 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 		 926 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  27.31 
 
 		 796 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.46 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.02 
 
 		 553 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.9 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.73 
 
 		 878 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  25.45 
 
 		 1159 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.62 
 
 		 613 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.11 
 
 		 755 aa  76.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  28.23 
 
 		 537 aa  75.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  26.27 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.4 
 
 		 602 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.87 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.94 
 
 		 599 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.19 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.07 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.69 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  27.83 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.74 
 
 		 812 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.12 
 
 		 570 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  26.69 
 
 		 579 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  27.24 
 
 		 559 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.88 
 
 		 460 aa  72.8  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>