More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  100 
 
 
1122 aa  2146    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.81 
 
 
1202 aa  555  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  69.51 
 
 
1078 aa  552  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  47.52 
 
 
1159 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.15 
 
 
841 aa  545  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  69.55 
 
 
872 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  67.86 
 
 
796 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.9 
 
 
926 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.3 
 
 
863 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.48 
 
 
834 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  62.09 
 
 
801 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.76 
 
 
808 aa  496  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.85 
 
 
872 aa  495  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.58 
 
 
743 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.01 
 
 
690 aa  485  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.77 
 
 
715 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  59.9 
 
 
737 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.58 
 
 
960 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.35 
 
 
774 aa  479  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.63 
 
 
637 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.65 
 
 
729 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.64 
 
 
732 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.47 
 
 
855 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  62.91 
 
 
727 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.97 
 
 
712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  46.41 
 
 
690 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.47 
 
 
812 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.4 
 
 
652 aa  466  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.09 
 
 
692 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.27 
 
 
678 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.71 
 
 
643 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.16 
 
 
578 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.85 
 
 
765 aa  452  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.5 
 
 
616 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.5 
 
 
616 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.64 
 
 
713 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.75 
 
 
618 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  44.57 
 
 
582 aa  298  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.18 
 
 
579 aa  298  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.46 
 
 
582 aa  292  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.91 
 
 
589 aa  288  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.73 
 
 
579 aa  288  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.42 
 
 
569 aa  288  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.48 
 
 
518 aa  281  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.24 
 
 
735 aa  281  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.07 
 
 
602 aa  281  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.33 
 
 
632 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.44 
 
 
582 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.23 
 
 
551 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.5 
 
 
606 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.62 
 
 
579 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
588 aa  270  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40 
 
 
900 aa  268  5e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.36 
 
 
550 aa  268  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.22 
 
 
601 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.4 
 
 
397 aa  264  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.32 
 
 
617 aa  264  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.1 
 
 
601 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45 
 
 
649 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.45 
 
 
561 aa  262  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40 
 
 
559 aa  260  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.44 
 
 
599 aa  260  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.31 
 
 
634 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.78 
 
 
427 aa  259  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.07 
 
 
554 aa  258  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.28 
 
 
568 aa  258  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  39.61 
 
 
650 aa  258  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  40 
 
 
652 aa  257  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.1 
 
 
606 aa  257  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.73 
 
 
565 aa  257  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.73 
 
 
565 aa  257  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.33 
 
 
755 aa  256  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.86 
 
 
663 aa  256  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.83 
 
 
398 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.85 
 
 
401 aa  254  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.78 
 
 
567 aa  254  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 
396 aa  254  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.15 
 
 
610 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.61 
 
 
562 aa  253  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.59 
 
 
614 aa  253  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  42.71 
 
 
396 aa  253  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 
696 aa  252  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40 
 
 
807 aa  251  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.61 
 
 
732 aa  251  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.18 
 
 
613 aa  251  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.86 
 
 
562 aa  250  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
562 aa  250  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.86 
 
 
562 aa  250  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
562 aa  250  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.16 
 
 
518 aa  250  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.62 
 
 
611 aa  250  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.7 
 
 
637 aa  250  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.62 
 
 
562 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
562 aa  249  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.58 
 
 
591 aa  249  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.19 
 
 
562 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.47 
 
 
550 aa  249  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.47 
 
 
562 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.83 
 
 
520 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.3 
 
 
644 aa  248  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>