More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6564 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  74.43 
 
 
812 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
855 aa  1647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.26 
 
 
637 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.47 
 
 
808 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.58 
 
 
732 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.97 
 
 
729 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.95 
 
 
834 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.75 
 
 
863 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  67.19 
 
 
727 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.75 
 
 
715 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.46 
 
 
743 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  50.77 
 
 
690 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.98 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.32 
 
 
774 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.64 
 
 
737 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.47 
 
 
690 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.68 
 
 
1202 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.11 
 
 
765 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.89 
 
 
1078 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.57 
 
 
652 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.63 
 
 
578 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  64.06 
 
 
796 aa  496  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.67 
 
 
841 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.81 
 
 
926 aa  485  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.45 
 
 
616 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.45 
 
 
616 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.36 
 
 
872 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.18 
 
 
618 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.58 
 
 
878 aa  475  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.66 
 
 
643 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  62.34 
 
 
1159 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.53 
 
 
678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  62.47 
 
 
1122 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.87 
 
 
872 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.98 
 
 
712 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  42.32 
 
 
801 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  56.5 
 
 
960 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.42 
 
 
589 aa  318  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  43.57 
 
 
582 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.56 
 
 
582 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.21 
 
 
579 aa  300  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.93 
 
 
579 aa  299  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.42 
 
 
569 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.3 
 
 
551 aa  288  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
649 aa  287  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.62 
 
 
602 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.2 
 
 
561 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.86 
 
 
427 aa  281  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.54 
 
 
562 aa  281  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.06 
 
 
582 aa  280  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.44 
 
 
562 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  38.93 
 
 
396 aa  278  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.5 
 
 
559 aa  278  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
735 aa  278  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.44 
 
 
562 aa  277  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.11 
 
 
570 aa  277  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.54 
 
 
567 aa  277  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.69 
 
 
562 aa  277  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.06 
 
 
579 aa  277  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37 
 
 
562 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  43.85 
 
 
614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.29 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.5 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  43.59 
 
 
625 aa  275  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
755 aa  274  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.75 
 
 
562 aa  274  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 
601 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.65 
 
 
599 aa  273  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.68 
 
 
562 aa  273  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.5 
 
 
562 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.11 
 
 
601 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.49 
 
 
554 aa  272  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.42 
 
 
610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.89 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.25 
 
 
606 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  40.93 
 
 
652 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.65 
 
 
663 aa  268  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
588 aa  268  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.84 
 
 
606 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  42.05 
 
 
526 aa  267  7e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.73 
 
 
547 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.87 
 
 
632 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.39 
 
 
685 aa  265  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.15 
 
 
553 aa  265  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.56 
 
 
591 aa  264  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.95 
 
 
550 aa  264  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.94 
 
 
642 aa  263  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  43.84 
 
 
604 aa  263  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.29 
 
 
554 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.11 
 
 
518 aa  263  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  42.99 
 
 
957 aa  263  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.11 
 
 
642 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.27 
 
 
643 aa  263  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.2 
 
 
644 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>