More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0062 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  77.22 
 
 
625 aa  844    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  100 
 
 
614 aa  1202    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  69.06 
 
 
604 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  51.22 
 
 
578 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  45.84 
 
 
565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  46.15 
 
 
565 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  51.38 
 
 
652 aa  555  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.63 
 
 
663 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  41.38 
 
 
584 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  49.63 
 
 
650 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  40.65 
 
 
579 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.96 
 
 
695 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  40.26 
 
 
586 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.44 
 
 
730 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  40.38 
 
 
595 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2118  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.6 
 
 
650 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000251378  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2074  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.95 
 
 
648 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.99 
 
 
452 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.03 
 
 
611 aa  317  6e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.99 
 
 
588 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.14 
 
 
554 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.43 
 
 
589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.25 
 
 
462 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.04 
 
 
561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.64 
 
 
550 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.77 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.65 
 
 
559 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.62 
 
 
518 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  39.47 
 
 
582 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.21 
 
 
562 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  51 
 
 
427 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.09 
 
 
567 aa  300  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.99 
 
 
562 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.22 
 
 
562 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.99 
 
 
562 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.77 
 
 
527 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.94 
 
 
735 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.19 
 
 
562 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35 
 
 
562 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.14 
 
 
589 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  43.18 
 
 
429 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.87 
 
 
602 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.78 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.78 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  38.98 
 
 
559 aa  294  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35 
 
 
562 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.56 
 
 
579 aa  294  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.91 
 
 
570 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.57 
 
 
599 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.63 
 
 
520 aa  293  6e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.47 
 
 
614 aa  292  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.57 
 
 
582 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  39 
 
 
562 aa  291  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.17 
 
 
601 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.17 
 
 
601 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.35 
 
 
562 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.32 
 
 
732 aa  290  7e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.35 
 
 
562 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.32 
 
 
606 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.5 
 
 
550 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.11 
 
 
855 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.14 
 
 
602 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.47 
 
 
565 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.47 
 
 
565 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  34.74 
 
 
548 aa  286  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.05 
 
 
579 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.9 
 
 
551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.52 
 
 
547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.44 
 
 
649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.82 
 
 
518 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.84 
 
 
606 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  41.5 
 
 
900 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  36.48 
 
 
568 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.58 
 
 
613 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.49 
 
 
554 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  36.85 
 
 
537 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.17 
 
 
755 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.39 
 
 
582 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.06 
 
 
582 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.31 
 
 
547 aa  283  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.44 
 
 
538 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.59 
 
 
610 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.92 
 
 
540 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.24 
 
 
586 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.49 
 
 
637 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.72 
 
 
395 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.54 
 
 
634 aa  280  7e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  38.89 
 
 
396 aa  279  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.29 
 
 
812 aa  279  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.78 
 
 
565 aa  279  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.2 
 
 
634 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.52 
 
 
522 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.02 
 
 
617 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.84 
 
 
553 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.62 
 
 
575 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.34 
 
 
569 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.57 
 
 
647 aa  277  5e-73  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.02 
 
 
579 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  42.82 
 
 
807 aa  276  6e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>