More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0694 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  100 
 
 
1202 aa  2336    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  97.22 
 
 
1078 aa  812    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  76.84 
 
 
841 aa  615  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.58 
 
 
1159 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  75.2 
 
 
878 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  74.69 
 
 
872 aa  594  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  75.19 
 
 
926 aa  592  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  71.83 
 
 
872 aa  575  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.57 
 
 
863 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  67.96 
 
 
796 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  69.51 
 
 
1122 aa  548  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.88 
 
 
678 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.21 
 
 
712 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  65.54 
 
 
727 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.27 
 
 
729 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.9 
 
 
715 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.92 
 
 
637 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.43 
 
 
834 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.68 
 
 
774 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.21 
 
 
732 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.58 
 
 
692 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  58.16 
 
 
737 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.27 
 
 
808 aa  513  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.52 
 
 
690 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.6 
 
 
855 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  62.97 
 
 
765 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  60.91 
 
 
652 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.69 
 
 
578 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.19 
 
 
713 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.44 
 
 
643 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  59.16 
 
 
801 aa  482  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  59.62 
 
 
690 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.04 
 
 
812 aa  483  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.95 
 
 
616 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.95 
 
 
616 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.6 
 
 
618 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.3 
 
 
960 aa  469  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.85 
 
 
579 aa  318  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.01 
 
 
582 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.97 
 
 
579 aa  303  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  41.44 
 
 
582 aa  303  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.81 
 
 
569 aa  300  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.03 
 
 
551 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.67 
 
 
582 aa  292  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.26 
 
 
579 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.97 
 
 
561 aa  288  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.59 
 
 
562 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.98 
 
 
632 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.27 
 
 
570 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.2 
 
 
735 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.34 
 
 
562 aa  283  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.13 
 
 
518 aa  281  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.34 
 
 
562 aa  281  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.09 
 
 
562 aa  280  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.09 
 
 
562 aa  280  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.09 
 
 
562 aa  280  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.09 
 
 
562 aa  280  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.09 
 
 
562 aa  279  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.34 
 
 
562 aa  280  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.84 
 
 
562 aa  277  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.84 
 
 
562 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  37.89 
 
 
900 aa  275  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.23 
 
 
589 aa  273  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.02 
 
 
602 aa  273  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.13 
 
 
649 aa  272  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.1 
 
 
559 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.2 
 
 
588 aa  269  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.1 
 
 
807 aa  269  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.33 
 
 
591 aa  268  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.8 
 
 
606 aa  267  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.98 
 
 
617 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.66 
 
 
755 aa  266  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.27 
 
 
601 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.27 
 
 
601 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
663 aa  265  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.51 
 
 
518 aa  265  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.33 
 
 
724 aa  264  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.78 
 
 
599 aa  264  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  38.87 
 
 
652 aa  264  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.32 
 
 
527 aa  262  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  38.74 
 
 
650 aa  260  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.77 
 
 
611 aa  260  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.9 
 
 
644 aa  260  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.16 
 
 
606 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.63 
 
 
554 aa  258  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.01 
 
 
567 aa  258  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.65 
 
 
565 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.65 
 
 
565 aa  256  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.53 
 
 
637 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.47 
 
 
690 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.86 
 
 
547 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.76 
 
 
427 aa  255  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.51 
 
 
520 aa  255  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37 
 
 
695 aa  255  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.03 
 
 
1071 aa  255  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.46 
 
 
1113 aa  254  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
948 aa  254  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.03 
 
 
1045 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.75 
 
 
1040 aa  253  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.91 
 
 
622 aa  252  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>