More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9315 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  59.42 
 
 
732 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  80.68 
 
 
715 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.65 
 
 
729 aa  808    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
727 aa  1424    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.78 
 
 
637 aa  591  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.62 
 
 
863 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.67 
 
 
743 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  53.22 
 
 
690 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.85 
 
 
737 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.52 
 
 
690 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  69.97 
 
 
834 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.02 
 
 
812 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.15 
 
 
808 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1281  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.08 
 
 
652 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.18 
 
 
578 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.98 
 
 
774 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.8 
 
 
1078 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  67.19 
 
 
855 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.65 
 
 
765 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0317  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.77 
 
 
678 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65 
 
 
643 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.54 
 
 
713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.15 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.6 
 
 
878 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.15 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.97 
 
 
796 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.85 
 
 
841 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.15 
 
 
618 aa  515  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  65.23 
 
 
872 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.9 
 
 
926 aa  502  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.87 
 
 
1159 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  62.91 
 
 
1122 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64 
 
 
712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.82 
 
 
872 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  54.76 
 
 
801 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.63 
 
 
960 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  44.05 
 
 
579 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.9 
 
 
582 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.76 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.81 
 
 
551 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.54 
 
 
589 aa  304  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.31 
 
 
579 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.2 
 
 
569 aa  293  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.78 
 
 
582 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.78 
 
 
579 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.22 
 
 
735 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.97 
 
 
562 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.97 
 
 
562 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.56 
 
 
562 aa  280  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  33.88 
 
 
900 aa  280  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.8 
 
 
562 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.28 
 
 
550 aa  279  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.14 
 
 
518 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.89 
 
 
567 aa  279  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.56 
 
 
562 aa  280  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.27 
 
 
562 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.34 
 
 
562 aa  277  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.05 
 
 
562 aa  277  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.79 
 
 
562 aa  276  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.8 
 
 
562 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.14 
 
 
518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.68 
 
 
561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
562 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.62 
 
 
559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.56 
 
 
649 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.2 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.37 
 
 
755 aa  270  5.9999999999999995e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  39.84 
 
 
396 aa  269  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.25 
 
 
601 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.5 
 
 
599 aa  269  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.25 
 
 
601 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.66 
 
 
547 aa  267  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.11 
 
 
527 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  40.1 
 
 
807 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.17 
 
 
570 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.12 
 
 
688 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.41 
 
 
606 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  40.11 
 
 
396 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.69 
 
 
606 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  40.14 
 
 
652 aa  263  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
427 aa  262  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.15 
 
 
617 aa  262  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.78 
 
 
591 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.25 
 
 
610 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.03 
 
 
602 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.16 
 
 
637 aa  261  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.61 
 
 
522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.4 
 
 
632 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  43.14 
 
 
614 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.4 
 
 
611 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.22 
 
 
562 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.94 
 
 
550 aa  259  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.82 
 
 
397 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
520 aa  259  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.34 
 
 
540 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0368  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  43.51 
 
 
602 aa  259  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.000122178 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.28 
 
 
529 aa  259  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.12 
 
 
690 aa  258  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.29 
 
 
401 aa  258  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.07 
 
 
622 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>