More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00770 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  100 
 
 		 363 aa  742    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  52.35 
 
 		 387 aa  378  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  50.7 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  47.15 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  47.21 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  38.89 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  39.48 
 
 		 328 aa  233  6e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  41.02 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  40.88 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  40.79 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  38.66 
 
 		 398 aa  229  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  39.53 
 
 		 319 aa  228  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  38.62 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  39.3 
 
 		 320 aa  226  7e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  52.34 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  38.51 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  38.69 
 
 		 317 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  38.37 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  39.94 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  48.71 
 
 		 322 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  47.62 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  45.42 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  39.58 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  37.5 
 
 		 322 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  39.64 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  36.2 
 
 		 327 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  35.96 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  36.23 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  36.09 
 
 		 322 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  43.98 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  36.01 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  36.8 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  44.18 
 
 		 321 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  47.2 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  37.39 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  37.43 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  36.39 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  35.91 
 
 		 315 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  35.84 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  47.66 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  37.86 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  47 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  45.09 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  43.89 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  46.54 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  43.91 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  50.68 
 
 		 940 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0833  replication factor C small subunit 2  34.47 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304305  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04440  DNA clamp loader, putative  28.48 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0154026  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1233  replication factor C small subunit 2  37.33 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  27.79 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  30.29 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1881  replication factor C small subunit 2  36.6 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.633659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0919  replication factor C small subunit 2  33.04 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1664  replication factor C small subunit 2  34.05 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.137515 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50732  predicted protein  32.22 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76038  DNA replicationn factor C  29.41 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38748  predicted protein  27.87 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.53 
 
 		 589 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06300  DNA replication factor C subunit Rfc5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12250)  29.37 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.61 
 
 		 687 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  29.09 
 
 		 614 aa  96.3  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 		 625 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.47 
 
 		 627 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.17 
 
 		 604 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  28.16 
 
 		 652 aa  93.6  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.75 
 
 		 467 aa  93.6  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1957  replication factor C small subunit 2  28.77 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 478 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.45 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  28.81 
 
 		 526 aa  91.3  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  28.64 
 
 		 575 aa  90.5  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.97 
 
 		 478 aa  90.1  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1247  replication factor C small subunit 2  25 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.572777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.84 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  27.06 
 
 		 559 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.75 
 
 		 606 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  29.06 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  27.92 
 
 		 565 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.19 
 
 		 601 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  27.92 
 
 		 565 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.19 
 
 		 601 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.19 
 
 		 606 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.88 
 
 		 732 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.84 
 
 		 460 aa  87.4  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.91 
 
 		 496 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.72 
 
 		 527 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.87 
 
 		 960 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.87 
 
 		 550 aa  86.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  30.73 
 
 		 454 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  31.44 
 
 		 642 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0076  ATPase  24.4 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.62 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.95 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.96 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.55 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  26.37 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.68 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  27.59 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.49 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>